More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
299 aa  623  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  67.22 
 
 
299 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  67.01 
 
 
289 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  62 
 
 
304 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  57.09 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  52.88 
 
 
288 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  50.16 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  49.83 
 
 
290 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  51.92 
 
 
290 aa  289  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  49.83 
 
 
304 aa  280  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  48.01 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  45.65 
 
 
287 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  41.25 
 
 
324 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  48.92 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  41.76 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  43.59 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  47.51 
 
 
340 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  41.42 
 
 
316 aa  208  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  45.97 
 
 
265 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  43.19 
 
 
323 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  42.98 
 
 
275 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  40.29 
 
 
280 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  41.8 
 
 
323 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  37.89 
 
 
269 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  37.59 
 
 
316 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  41.43 
 
 
289 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  34.82 
 
 
398 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  31.9 
 
 
366 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  31.82 
 
 
363 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  39.86 
 
 
315 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  29.77 
 
 
344 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  32.59 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  32.59 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  32.59 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  29.43 
 
 
344 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  35.53 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  32.62 
 
 
284 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 
367 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  30.51 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  31.78 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  30.04 
 
 
380 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  30.4 
 
 
254 aa  112  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  30.62 
 
 
519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  30.81 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  28.41 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  29.19 
 
 
279 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  28.11 
 
 
374 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  28.11 
 
 
366 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.25 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  29.25 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  30.38 
 
 
292 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  27.54 
 
 
528 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  25.94 
 
 
524 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 
281 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  30.99 
 
 
375 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  31.99 
 
 
303 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  30.52 
 
 
375 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  30.97 
 
 
373 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  31.47 
 
 
351 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  30.05 
 
 
375 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  36.08 
 
 
255 aa  105  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  29.12 
 
 
334 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  29.85 
 
 
311 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 
401 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 
401 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  30.99 
 
 
375 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  29.7 
 
 
343 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  31.78 
 
 
375 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  29.61 
 
 
513 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0809  cytochrome-c oxidase  30.46 
 
 
247 aa  102  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  30.14 
 
 
320 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 
377 aa  102  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 
511 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  31.46 
 
 
311 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3875  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 
338 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  29.15 
 
 
294 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  28.29 
 
 
521 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 
388 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  30.6 
 
 
303 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  28.71 
 
 
513 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  30.69 
 
 
303 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  29.19 
 
 
513 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  29.38 
 
 
520 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  28.23 
 
 
513 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1002  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 
257 aa  101  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  28.35 
 
 
384 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  29.74 
 
 
285 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 
279 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 
334 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  32.09 
 
 
285 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  25.44 
 
 
523 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4321  cytochrome-c oxidase  31.34 
 
 
298 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018888  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  28.17 
 
 
518 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 
304 aa  99.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  31.43 
 
 
355 aa  99.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  26.17 
 
 
405 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4787  cytochrome-c oxidase  30.15 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
512 aa  99.8  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>