More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3150 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
340 aa  693    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  63.4 
 
 
314 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  52.87 
 
 
260 aa  278  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  49.44 
 
 
316 aa  265  8e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  52.57 
 
 
265 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  48.61 
 
 
288 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  48.06 
 
 
280 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  41.97 
 
 
287 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  45.58 
 
 
275 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  42.14 
 
 
324 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  42.58 
 
 
324 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  44.74 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  43.06 
 
 
299 aa  225  9e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  43.18 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  43.94 
 
 
289 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  43.53 
 
 
304 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  47.21 
 
 
288 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  43.96 
 
 
304 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  46.81 
 
 
323 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  45.28 
 
 
323 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  45.92 
 
 
289 aa  196  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  38.69 
 
 
316 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  39.04 
 
 
269 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  32.31 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  37.69 
 
 
290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  39.86 
 
 
312 aa  182  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  36.57 
 
 
398 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  39.83 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  41.77 
 
 
315 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  36.05 
 
 
363 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  36.53 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  36.53 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  36.53 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  35.91 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  34.71 
 
 
344 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  35.82 
 
 
286 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  36.25 
 
 
257 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  36 
 
 
366 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  33.7 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  33.83 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  32.45 
 
 
524 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  32.99 
 
 
311 aa  139  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  31.23 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  30.89 
 
 
523 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
519 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  33.95 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
388 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  30.37 
 
 
401 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  30.37 
 
 
401 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  31.47 
 
 
513 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 
513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 
513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  30.37 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.77 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  31.34 
 
 
398 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 
384 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  30.96 
 
 
513 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  30.65 
 
 
512 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  32.34 
 
 
281 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 
375 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 
518 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
375 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  31.12 
 
 
528 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 
520 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  30.35 
 
 
518 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 
544 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 
385 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 
513 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 
518 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  31.71 
 
 
343 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  30.2 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  31.12 
 
 
378 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  32.58 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 
304 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  30.89 
 
 
518 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  32.17 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  32.22 
 
 
524 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  33.96 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  29.5 
 
 
525 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  30.29 
 
 
521 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  30.27 
 
 
532 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  31.56 
 
 
557 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  28.68 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
531 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  29.71 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  30.61 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
532 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  32.49 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  30.15 
 
 
538 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  33.81 
 
 
284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
532 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 
388 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.32 
 
 
279 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  32.32 
 
 
279 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  30.69 
 
 
380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 
517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>