More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0956 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  52.08 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  48.29 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  51.61 
 
 		 287 aa  248  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  50.62 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  48.22 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  49.15 
 
 		 314 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  48.66 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  41.91 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  43.17 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  43.66 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  42.26 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  42.16 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  40.29 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  42.19 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  47.39 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  49.06 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  42.48 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  41.38 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  40.81 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  44.3 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  41.51 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  42.62 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  44.05 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  39.69 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  43.5 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  42.86 
 
 		 257 aa  175  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  33.01 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  34.77 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  38.1 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  30.87 
 
 		 363 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  39.57 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  32.51 
 
 		 344 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 344 aa  155  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  32.08 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  32.08 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  32.08 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  32.25 
 
 		 377 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  33.88 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  31.78 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29.21 
 
 		 377 aa  118  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  36.02 
 
 		 375 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  34.23 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  33.85 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  33.19 
 
 		 524 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  33.47 
 
 		 374 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  30.69 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  29.27 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 525 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  32.28 
 
 		 401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  32.28 
 
 		 401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  31.33 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 		 374 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 544 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 517 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 525 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 525 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 525 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.52 
 
 		 405 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 525 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 517 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 528 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 517 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  30.25 
 
 		 513 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  30.58 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 		 521 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  32.07 
 
 		 513 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  33.49 
 
 		 375 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  35.47 
 
 		 382 aa  109  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 		 557 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 		 375 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  29.58 
 
 		 513 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  30.19 
 
 		 532 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 		 375 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  33.51 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  31.38 
 
 		 520 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.2 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  30.32 
 
 		 512 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  31.65 
 
 		 524 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  31.17 
 
 		 511 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.58 
 
 		 513 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 513 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 532 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  30.4 
 
 		 518 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 532 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  28.41 
 
 		 373 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  29.09 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  32.84 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 532 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  30.87 
 
 		 378 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 		 518 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 		 531 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  31.56 
 
 		 390 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  28.73 
 
 		 538 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>