More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1824 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  40.68 
 
 		 288 aa  194  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  41.6 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  42.86 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  38.14 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  38.17 
 
 		 324 aa  168  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  36.74 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  32.68 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  35.74 
 
 		 290 aa  161  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  38.43 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  35.22 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  34.25 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  39.81 
 
 		 289 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  35.69 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  36.65 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  36.58 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  32.96 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  33.85 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  34.53 
 
 		 299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  34.83 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  34.55 
 
 		 323 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  35.55 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  35.35 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  34.69 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  29.5 
 
 		 363 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  31.49 
 
 		 398 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  29.5 
 
 		 344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  33.47 
 
 		 367 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  36.92 
 
 		 370 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  32.66 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  34.86 
 
 		 315 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  28.93 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  34.69 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  31.28 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  25.3 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  41.38 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  31.02 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  26.72 
 
 		 401 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  26.72 
 
 		 401 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.52 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  30.52 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3875  cytochrome c oxidase, subunit II  32.06 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  29.9 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  30.28 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  28.33 
 
 		 389 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  34.02 
 
 		 302 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  28.33 
 
 		 389 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  32.49 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  27.52 
 
 		 388 aa  96.3  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0913  cytochrome-c oxidase  28.72 
 
 		 349 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214333  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  28.99 
 
 		 287 aa  95.9  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  28.45 
 
 		 389 aa  95.5  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  27.95 
 
 		 303 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4321  cytochrome-c oxidase  28.44 
 
 		 298 aa  95.1  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 285 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  27.39 
 
 		 366 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  31.22 
 
 		 405 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  31.27 
 
 		 359 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 304 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 		 380 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  30.73 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  30.21 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  28.18 
 
 		 398 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  27.12 
 
 		 374 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  28.88 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  28.88 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  27.54 
 
 		 375 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.45 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 301 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  24.78 
 
 		 373 aa  92.4  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  27.12 
 
 		 375 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1039  cytochrome c oxidase subunit II  31.96 
 
 		 312 aa  92  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 375 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 		 300 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  30.19 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  29.21 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  29.21 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.45 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  28.27 
 
 		 375 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  25.96 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  26.29 
 
 		 375 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  28.5 
 
 		 426 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  27.57 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  27.57 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  25.96 
 
 		 308 aa  89.4  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  27.48 
 
 		 385 aa  89.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  26.34 
 
 		 511 aa  89.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  29 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4648  cytochrome c oxidase subunit II  31.43 
 
 		 286 aa  89  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5298  normal  0.167898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  30.89 
 
 		 294 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>