More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1367 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 311 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  61.83 
 
 		 315 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  52.12 
 
 		 316 aa  325  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  45.33 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  47.03 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  47.03 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  47.03 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  46.73 
 
 		 344 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  46.91 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  45.79 
 
 		 344 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  48.29 
 
 		 323 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  43.7 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  50.33 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  47.6 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  49.11 
 
 		 269 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  51.46 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  52.92 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  47.45 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  47.28 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  42.59 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  47.88 
 
 		 275 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  42.8 
 
 		 260 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  44.73 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  41.28 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  41.51 
 
 		 280 aa  193  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  39.27 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  39.66 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  38.67 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  37.32 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  36.19 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  34.53 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 		 288 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  35.27 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  37.29 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  34.96 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  38.57 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  33.69 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 401 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 401 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  32.17 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  29.28 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  30.62 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  30.55 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29.92 
 
 		 377 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  27.3 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 518 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  27.93 
 
 		 544 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.11 
 
 		 513 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  30.09 
 
 		 519 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 		 513 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  29.11 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 528 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  28.39 
 
 		 518 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  30.66 
 
 		 524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  28.27 
 
 		 513 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  27.66 
 
 		 512 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 		 513 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  30.29 
 
 		 511 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  30.52 
 
 		 520 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  27.98 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  29.57 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  29.89 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  34.42 
 
 		 346 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  29.86 
 
 		 524 aa  105  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  33.83 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  29.13 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  30.39 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.15 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  29.15 
 
 		 538 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  29.47 
 
 		 521 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  29.73 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  27.92 
 
 		 523 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  29.91 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.3 
 
 		 421 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 		 525 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  28.7 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  29.95 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  28.7 
 
 		 375 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 		 517 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 		 525 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 		 517 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 		 525 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 		 525 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 		 525 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 		 517 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  28.7 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  27.85 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  29.25 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  29.25 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 		 532 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  29.25 
 
 		 532 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 		 535 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  27.94 
 
 		 557 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 		 535 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>