More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3300 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 323 aa  663    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  92.26 
 
 		 323 aa  568  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  61.74 
 
 		 269 aa  351  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  55.16 
 
 		 289 aa  275  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  46.06 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  40.83 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  42.59 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  41.81 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  41.81 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  41.81 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  43.53 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  48.91 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  46.03 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  41.67 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  51.02 
 
 		 288 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  47.22 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  45.25 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  43.26 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  41.07 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  44 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  43.63 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  40.63 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  45.96 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  40.47 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  44.3 
 
 		 287 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  46.86 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  44.02 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  44.25 
 
 		 275 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  46.12 
 
 		 265 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  37.46 
 
 		 304 aa  188  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  39.04 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  41.42 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  39.25 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  34.29 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  50.37 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  30.8 
 
 		 524 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  31.46 
 
 		 519 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  32.73 
 
 		 388 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  32.33 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  31.01 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  31.42 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 405 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  29.61 
 
 		 373 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  30.88 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  31.38 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  30.9 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  29.08 
 
 		 512 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  30.8 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 		 418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  29.73 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  29.86 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 		 544 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  29.73 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  29.49 
 
 		 520 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  29.58 
 
 		 375 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.62 
 
 		 421 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  29.53 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  30.4 
 
 		 525 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  29.45 
 
 		 422 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  29.2 
 
 		 513 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  28.12 
 
 		 521 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29.26 
 
 		 377 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 		 513 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  29.34 
 
 		 375 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  28.79 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 		 523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 525 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 525 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  30.54 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 525 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 517 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 517 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 525 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  28.62 
 
 		 538 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 517 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  27.63 
 
 		 524 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 518 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 		 513 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  30.1 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 518 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 518 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  27.09 
 
 		 511 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  28.52 
 
 		 513 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  27.66 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  28.44 
 
 		 513 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  29.3 
 
 		 532 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  29.2 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>