More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14120 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 312 aa  648    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  55.14 
 
 		 299 aa  335  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  58.57 
 
 		 289 aa  330  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  52.68 
 
 		 304 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  53.1 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  52.85 
 
 		 288 aa  295  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  49.83 
 
 		 290 aa  289  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  51.36 
 
 		 290 aa  277  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  44.87 
 
 		 324 aa  271  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  43.32 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  49.06 
 
 		 286 aa  255  8e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  41.26 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  42.01 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  39.02 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  42.97 
 
 		 314 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  41.42 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  41.15 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  41.63 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  41.3 
 
 		 265 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  39.73 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  36.03 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  42.32 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  37.71 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  36.26 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  38.16 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  32.59 
 
 		 398 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  36.13 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  37.67 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  34.78 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  29.97 
 
 		 366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  27.94 
 
 		 363 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  28.52 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  33.46 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  32.21 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  29.03 
 
 		 370 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  29.6 
 
 		 524 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  29.71 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.23 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.69 
 
 		 513 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  29.26 
 
 		 513 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  29.26 
 
 		 513 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  27.95 
 
 		 528 aa  105  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  28.82 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  29.28 
 
 		 521 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  27.55 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  30.42 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  27.75 
 
 		 512 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  28.7 
 
 		 384 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  29.13 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 513 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  30.57 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.38 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  29.6 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  28.38 
 
 		 511 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  26.09 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 		 518 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 373 aa  99.4  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  28.07 
 
 		 374 aa  99  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.05 
 
 		 518 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  28.05 
 
 		 518 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.99 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  27.31 
 
 		 523 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  28 
 
 		 518 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 		 520 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  24.72 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  25.78 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  25.79 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  25.09 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  28.38 
 
 		 524 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  26.1 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.02 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  31.12 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.32 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.16 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.32 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  27.63 
 
 		 378 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  29.88 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  28.34 
 
 		 329 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  27.45 
 
 		 346 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 		 375 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 		 401 aa  95.9  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 		 401 aa  95.9  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  31.68 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  39.68 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  29.57 
 
 		 399 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  34.65 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.71 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  26.41 
 
 		 519 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  29.03 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.96 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>