More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1453 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 299 aa  621  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  67.22 
 
 		 299 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  60.98 
 
 		 289 aa  363  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  61.81 
 
 		 304 aa  358  5e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  56.19 
 
 		 288 aa  342  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  55.21 
 
 		 312 aa  306  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  52.61 
 
 		 324 aa  298  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  50.52 
 
 		 290 aa  291  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  50.34 
 
 		 290 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  51.25 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  46.76 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  44.16 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  42.04 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  45 
 
 		 260 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  49.34 
 
 		 340 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  47.39 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  42.26 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  43.32 
 
 		 265 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  43.27 
 
 		 275 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  44.4 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  47.01 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  42.75 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  43.28 
 
 		 323 aa  198  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  38.19 
 
 		 269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  39.53 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  35.5 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  34.53 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  31.73 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  32.08 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  31.51 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  30.27 
 
 		 344 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 		 352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 		 352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 		 352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  37.1 
 
 		 257 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  29.35 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  35.22 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  34.78 
 
 		 374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  34.63 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  33.04 
 
 		 513 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  34.2 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  33.77 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  33.6 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 		 513 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  32.76 
 
 		 375 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  33.19 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  32.17 
 
 		 513 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  31.84 
 
 		 524 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  33.77 
 
 		 375 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  29.74 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  31.64 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  31.52 
 
 		 384 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  31.38 
 
 		 521 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  30.08 
 
 		 511 aa  123  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  32.03 
 
 		 519 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  30.87 
 
 		 512 aa  122  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 		 528 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  32.17 
 
 		 520 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 		 513 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  30.87 
 
 		 513 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 		 523 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 		 518 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  34.67 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 		 518 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  30.36 
 
 		 518 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.36 
 
 		 518 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.77 
 
 		 355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  33.47 
 
 		 374 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  31.53 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  33.05 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  30.47 
 
 		 385 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  32.79 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.38 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  32.38 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  28.1 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  30.33 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  31.17 
 
 		 378 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  32.55 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  28.88 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30.5 
 
 		 351 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  30.32 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  29.2 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.93 
 
 		 337 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  29.63 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  32.23 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  32.93 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  30.47 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  28.42 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>