More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2275 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  94.66 
 
 
337 aa  657    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
337 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  94.66 
 
 
337 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  45.28 
 
 
316 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  40.36 
 
 
330 aa  231  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  38.76 
 
 
330 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  39.13 
 
 
329 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  39.06 
 
 
318 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  35.53 
 
 
342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  37.15 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 
350 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 
350 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  36.31 
 
 
358 aa  208  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 
350 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  37.62 
 
 
302 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  37.79 
 
 
362 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  38.16 
 
 
301 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  39.09 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 
314 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  36.3 
 
 
300 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.16 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  37.46 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  39.87 
 
 
399 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 
318 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  40.36 
 
 
405 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  38.96 
 
 
313 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  40.19 
 
 
310 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.47 
 
 
389 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  36.18 
 
 
288 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.62 
 
 
316 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  35.28 
 
 
359 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  34.05 
 
 
382 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  33.95 
 
 
382 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  38.11 
 
 
408 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  34.06 
 
 
394 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  38.65 
 
 
426 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  33.87 
 
 
382 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  33.87 
 
 
382 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  34.7 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  30.06 
 
 
388 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  32.79 
 
 
384 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  31.67 
 
 
384 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  33.65 
 
 
329 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  30.22 
 
 
444 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  28.45 
 
 
391 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  33.75 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.59 
 
 
324 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  34.01 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 
320 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 
320 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 
311 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  34.13 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  37.69 
 
 
211 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  32.97 
 
 
339 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  31.01 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  30.87 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  33.21 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  35.04 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.49 
 
 
370 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
367 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  38.29 
 
 
330 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.93 
 
 
274 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  31.44 
 
 
352 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 
344 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.65 
 
 
270 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 
328 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.22 
 
 
270 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.89 
 
 
355 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.17 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
327 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  32.26 
 
 
346 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  33.21 
 
 
371 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  31.61 
 
 
338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  29.8 
 
 
353 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  33.03 
 
 
324 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  46.46 
 
 
355 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  34.76 
 
 
311 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  30.19 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  30.62 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.6 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  47.32 
 
 
360 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  32.01 
 
 
324 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  32.72 
 
 
324 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  28.71 
 
 
355 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  49.53 
 
 
351 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  31.13 
 
 
336 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  28.01 
 
 
385 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.42 
 
 
267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.64 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  30.94 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.64 
 
 
267 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  29.17 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  30.45 
 
 
334 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  26.32 
 
 
405 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  29.5 
 
 
273 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  32.95 
 
 
345 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  30.49 
 
 
272 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  30.06 
 
 
359 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 
314 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>