More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0523 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 353 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  42.17 
 
 		 373 aa  272  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  44.89 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  42.55 
 
 		 370 aa  265  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  42.9 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  34.96 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.06 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  36.61 
 
 		 391 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  36.17 
 
 		 272 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  34.98 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  37.45 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  36.17 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  36.17 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  32.79 
 
 		 280 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  32.96 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  34.75 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  34.75 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  34.89 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  34.08 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  34.47 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  33.62 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  33.74 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  32.66 
 
 		 271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  32.39 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  29.58 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29.58 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  29.88 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.77 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  28.34 
 
 		 342 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.33 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  27.13 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  27.07 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  26.72 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  28.52 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 279 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  28.04 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  29.65 
 
 		 405 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 279 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  25.91 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  27.27 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  29.54 
 
 		 304 aa  93.2  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  25.72 
 
 		 375 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.73 
 
 		 270 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  26.21 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  28.84 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  26.84 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  25.94 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.37 
 
 		 270 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  27.7 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  25.81 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  24.69 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  26.32 
 
 		 358 aa  89.7  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  30.23 
 
 		 288 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  25.81 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  24.39 
 
 		 318 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  24.83 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  24.83 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  29.41 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  25.33 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  29.07 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  25.79 
 
 		 408 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  27.5 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  26.38 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  25.82 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  27.21 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  25.66 
 
 		 339 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  26.87 
 
 		 270 aa  86.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  27.17 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  26.98 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  26.79 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  27.91 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  27.17 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  25.78 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  24.12 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  26.32 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  23.18 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  27.08 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  26.72 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  24.71 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  26.34 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  26.22 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  25.94 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  26.61 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  25.4 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  33.54 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  24.7 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  23.68 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  26.46 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  26.22 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  25.52 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  26.27 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  23.65 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  24.22 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>