More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0222 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 288 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  68.4 
 
 		 302 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  59.58 
 
 		 300 aa  371  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  58.54 
 
 		 301 aa  357  9e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  50.17 
 
 		 318 aa  311  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  48.51 
 
 		 408 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  45.96 
 
 		 405 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  47.33 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  44.56 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  42.18 
 
 		 311 aa  228  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  41.61 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  38.24 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  36.16 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  39.1 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  35.33 
 
 		 342 aa  208  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  36.86 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  36.86 
 
 		 337 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  34.97 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.46 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  39.64 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  34.69 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  36.18 
 
 		 337 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  39.56 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  40.3 
 
 		 362 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  38.06 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  33.55 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  39.78 
 
 		 362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 314 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  33.56 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  38.83 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  37.13 
 
 		 313 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  32.62 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  32.42 
 
 		 382 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  32.42 
 
 		 382 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  32.62 
 
 		 321 aa  168  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  32.21 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  32.23 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  32.93 
 
 		 384 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  30.72 
 
 		 388 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  31.09 
 
 		 391 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  31.93 
 
 		 382 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  29.97 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  37.57 
 
 		 211 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  25.16 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.65 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  25.32 
 
 		 349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  25.32 
 
 		 349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  25.32 
 
 		 349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  25.32 
 
 		 349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  25.32 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  25.32 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  25.32 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  25.32 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  25.32 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  29.74 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  25.32 
 
 		 349 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  26.86 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  33.86 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  32.71 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  26.76 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  27.09 
 
 		 351 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  28.62 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  29.19 
 
 		 255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  25.76 
 
 		 525 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  25.76 
 
 		 525 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  25.76 
 
 		 525 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  25.76 
 
 		 517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  25.45 
 
 		 377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  25.76 
 
 		 525 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  25.76 
 
 		 517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  25.76 
 
 		 517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  25.76 
 
 		 525 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  26.95 
 
 		 532 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  26.95 
 
 		 532 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  26.56 
 
 		 532 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  31.07 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  25.53 
 
 		 377 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  27.03 
 
 		 532 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  32.18 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  26.74 
 
 		 557 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  26.25 
 
 		 538 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  26.06 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  25.15 
 
 		 544 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  26.17 
 
 		 531 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  33.17 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  30.91 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  32.54 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  25.66 
 
 		 382 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  33.18 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  31.6 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  23.72 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  31.19 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  32.21 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  26.47 
 
 		 321 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  27.49 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>