More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2345 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  46.39 
 
 		 391 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  46.49 
 
 		 285 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  46.12 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  46.56 
 
 		 273 aa  255  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  44.23 
 
 		 384 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  48.59 
 
 		 272 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  41.95 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  41.95 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  49.79 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  43.85 
 
 		 382 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  43.85 
 
 		 382 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  47.54 
 
 		 444 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  44.66 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  47.39 
 
 		 272 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  43.65 
 
 		 394 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  45.23 
 
 		 384 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.16 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  36.73 
 
 		 347 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  30.42 
 
 		 359 aa  151  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  31.45 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  33.21 
 
 		 373 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  32.66 
 
 		 353 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  30.28 
 
 		 370 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  30.66 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.75 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.67 
 
 		 211 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  28.95 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  37.01 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  35.18 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  30.91 
 
 		 401 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  30.91 
 
 		 401 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  32.62 
 
 		 351 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  31.9 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  33.83 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.94 
 
 		 362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  31.42 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  38.55 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  29.92 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.6 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.07 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  34.18 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.16 
 
 		 359 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.87 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  29.91 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.89 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  34.91 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  33.76 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  31.37 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 		 525 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 		 532 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  32.24 
 
 		 538 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  32.37 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 		 532 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 525 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 517 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 525 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 517 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 525 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 		 532 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 525 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 517 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  32.24 
 
 		 544 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.1 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  31.76 
 
 		 531 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  31.86 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  26.59 
 
 		 405 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.2 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  30.7 
 
 		 380 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  30.93 
 
 		 557 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  33.18 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 		 535 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 		 535 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  30.53 
 
 		 408 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  30.9 
 
 		 532 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 		 387 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  31.88 
 
 		 528 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  40.65 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.28 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  31.44 
 
 		 511 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  51.11 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.67 
 
 		 389 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.43 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  30.36 
 
 		 426 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  47.31 
 
 		 360 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.43 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  32.08 
 
 		 377 aa  99.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  46.94 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  49.43 
 
 		 355 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>