More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2207 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  100 
 
 
347 aa  723    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  50.3 
 
 
373 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  52.12 
 
 
370 aa  338  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  44.89 
 
 
353 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  40.21 
 
 
408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  35.2 
 
 
359 aa  218  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.86 
 
 
396 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  38.93 
 
 
272 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  37.92 
 
 
272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  36.84 
 
 
314 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  34.46 
 
 
388 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  35.54 
 
 
384 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  30.56 
 
 
391 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  36.73 
 
 
271 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  32.74 
 
 
269 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  32.88 
 
 
280 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  33.69 
 
 
285 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  34.28 
 
 
273 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  32.11 
 
 
444 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  31.58 
 
 
384 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  31.36 
 
 
382 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  31.36 
 
 
382 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  30.61 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  31.12 
 
 
382 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  31.51 
 
 
394 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  30.64 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 
267 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  31.4 
 
 
269 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  26.07 
 
 
336 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.03 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  27.84 
 
 
358 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  26.73 
 
 
339 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.76 
 
 
324 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  30.15 
 
 
344 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 
276 aa  106  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.08 
 
 
267 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.77 
 
 
291 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.12 
 
 
267 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.73 
 
 
267 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.12 
 
 
270 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.04 
 
 
270 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  25.58 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  30.56 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  27.07 
 
 
408 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  28.09 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  22.87 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  22.87 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 
211 aa  96.3  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.09 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  30.47 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  26.46 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  26.73 
 
 
316 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  28.33 
 
 
342 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.86 
 
 
314 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  28.08 
 
 
275 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  27.39 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  27.46 
 
 
337 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  27.57 
 
 
351 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.13 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27.05 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.68 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  26.33 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  27.13 
 
 
405 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 
362 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  25.42 
 
 
304 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
385 aa  89.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 
328 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  39.17 
 
 
351 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  28.09 
 
 
385 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  26.89 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  26.53 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 
390 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  27.87 
 
 
316 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.25 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.84 
 
 
421 aa  85.9  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  26.97 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  26.97 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  29.55 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  25.61 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  29.55 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  25.5 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  25.75 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  27.2 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  26.47 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  27.94 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  25.74 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.94 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  24.66 
 
 
301 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  28.79 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  25.75 
 
 
375 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  26.89 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  26.09 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  29.6 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  27.16 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>