More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1640 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  100 
 
 
396 aa  816    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  56.9 
 
 
359 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  35.31 
 
 
408 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  36.97 
 
 
347 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  33.9 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  31.14 
 
 
373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  33.55 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
273 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  30.3 
 
 
280 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  31.16 
 
 
271 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  29.13 
 
 
285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  30.8 
 
 
272 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  30.45 
 
 
272 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  29.9 
 
 
391 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  31.43 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  28.27 
 
 
444 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  30.11 
 
 
382 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  30.11 
 
 
382 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  28.33 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  27.99 
 
 
382 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  27.99 
 
 
382 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  28.23 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  28.47 
 
 
384 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  26.55 
 
 
269 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 
394 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  30.18 
 
 
267 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  25.31 
 
 
336 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  24.1 
 
 
324 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  23.76 
 
 
314 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  25.83 
 
 
269 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  24.83 
 
 
315 aa  91.3  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  22.59 
 
 
321 aa  90.1  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  23.28 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  25.89 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  22.11 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  24.45 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  23.38 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  24.36 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  21.77 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  23.38 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  22.98 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  21.81 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  24.05 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  22.65 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  21.86 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  21.32 
 
 
276 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  22.65 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  22.31 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  22.31 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  24.03 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  25.35 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  24.91 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  21.94 
 
 
366 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  23.75 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  22.45 
 
 
318 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  22.31 
 
 
267 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  25.52 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  26.89 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  23.64 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  21.94 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  23.05 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  22.76 
 
 
320 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  23.53 
 
 
329 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  23.79 
 
 
274 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  22.76 
 
 
320 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  22.81 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  22.14 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.36 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  23.05 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  22.93 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  24.17 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  23.97 
 
 
519 aa  73.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.36 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  24.32 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  25.61 
 
 
525 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.22 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  23.44 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 
517 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  20.94 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 
517 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 
525 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 
517 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 
525 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 
525 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  24.48 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 
525 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  22.22 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  22.58 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  22.4 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  23.72 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  21.31 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  26.24 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  24.44 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  25.52 
 
 
531 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  25.52 
 
 
532 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  25.52 
 
 
532 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  22.48 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  21.65 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  22.95 
 
 
557 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>