More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2958 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  30.95 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  32.79 
 
 		 353 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  31.5 
 
 		 373 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.53 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.8 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  35.59 
 
 		 370 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  31.4 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  31.52 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  31.4 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  30.59 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  29.41 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  34.84 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  30.34 
 
 		 271 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  32.2 
 
 		 408 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  32.91 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.64 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  30.59 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  34.09 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  29.34 
 
 		 382 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  29.34 
 
 		 382 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  29.69 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  30.92 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.41 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  28.27 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  30.08 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  26.47 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.21 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.8 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  33.5 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  27.88 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  27.88 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  29.49 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  26.71 
 
 		 321 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  29.84 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  29.86 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  26.94 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  30.28 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  31.22 
 
 		 405 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  27.75 
 
 		 426 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  28.32 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  31.19 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  29.67 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.06 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  28.09 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29.49 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  29.32 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  29.32 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 		 380 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  29.32 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  29.55 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  30.74 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  28.2 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.5 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  29.46 
 
 		 390 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.02 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  28.26 
 
 		 308 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.45 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  27.6 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 		 355 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  30.73 
 
 		 425 aa  99.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.98 
 
 		 355 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 394 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 418 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 418 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  29.92 
 
 		 358 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  30.91 
 
 		 390 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 389 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  26.77 
 
 		 525 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  29.68 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  33.19 
 
 		 373 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.84 
 
 		 362 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 389 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  29.92 
 
 		 398 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  33.78 
 
 		 360 aa  96.3  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 		 313 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  33.18 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  27.95 
 
 		 382 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 351 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  28.15 
 
 		 532 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  41.03 
 
 		 318 aa  95.9  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 557 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  28.15 
 
 		 531 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  28.15 
 
 		 532 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  28.15 
 
 		 532 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  26.87 
 
 		 517 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  26.87 
 
 		 517 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  26.87 
 
 		 517 aa  95.5  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>