More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0278 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
302 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  66.01 
 
 
308 aa  421  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  69.28 
 
 
304 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  66.22 
 
 
298 aa  414  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  66.67 
 
 
316 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  48.08 
 
 
311 aa  279  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  44.78 
 
 
299 aa  252  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  45.59 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  41.01 
 
 
311 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  38.46 
 
 
276 aa  192  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  35.16 
 
 
275 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  35.41 
 
 
291 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  37.97 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.58 
 
 
270 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  37.64 
 
 
267 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.82 
 
 
274 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.58 
 
 
270 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  33.79 
 
 
328 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  37.64 
 
 
267 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  32.25 
 
 
321 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  32.17 
 
 
339 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
320 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
320 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.13 
 
 
267 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.31 
 
 
355 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.77 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 
336 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  31.83 
 
 
315 aa  159  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.33 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.16 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32.34 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.74 
 
 
362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  29.84 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  40.87 
 
 
351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  38.81 
 
 
360 aa  109  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  31.23 
 
 
330 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 
301 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 
358 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  27.88 
 
 
329 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 
399 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 
314 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.57 
 
 
316 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 
362 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 
313 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  30.9 
 
 
359 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  30.87 
 
 
362 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  38.98 
 
 
318 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 
302 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 
337 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 
337 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 
211 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  31.34 
 
 
318 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  28.2 
 
 
269 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  29.73 
 
 
337 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 
288 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  29.13 
 
 
321 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 
405 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.73 
 
 
350 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.73 
 
 
350 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  27.43 
 
 
426 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  30.05 
 
 
243 aa  94  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
350 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  27.54 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 
544 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  27.95 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  25.28 
 
 
557 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  29.21 
 
 
382 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  29.21 
 
 
382 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  25.81 
 
 
287 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  24.92 
 
 
538 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  31.37 
 
 
391 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 
382 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  33.79 
 
 
314 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  25.68 
 
 
311 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  31.58 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  30.92 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  31.58 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  28.24 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  29.25 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  30.83 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1508  ubiquinol oxidase, subunit II  28.46 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.205706  normal  0.237514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  37.27 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  28.78 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  25.81 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  26.69 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  35.04 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  25.62 
 
 
525 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  28.77 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  32.61 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  32.06 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  25.68 
 
 
525 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  25.68 
 
 
517 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  25.68 
 
 
525 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>