More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0658 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  53.97 
 
 
291 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  53.97 
 
 
291 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  53.97 
 
 
291 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  53.97 
 
 
291 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  53.97 
 
 
291 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  53.97 
 
 
291 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0758  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  53.97 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573305 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0737  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  53.57 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0350513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0591  quinol oxidase AA3, subunit II  52.38 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  55.34 
 
 
301 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4600  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  52.78 
 
 
291 aa  280  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00365456  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0618  quinol oxidase AA3, subunit II  52.38 
 
 
291 aa  260  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0511  cytochrome c oxidase subunit II  43.62 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.263206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0646  quinol oxidase, subunit II  37.01 
 
 
374 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519241  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1143  quinol oxidase AA3, subunit II  38.5 
 
 
366 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.058304  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1120  quinol oxidase AA3, subunit II  38.5 
 
 
366 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00144852  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0048  ubiquinol oxidase, subunit II  38.46 
 
 
335 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3536  ubiquinol oxidase, subunit II  36.89 
 
 
269 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  36.19 
 
 
349 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0899  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  35.88 
 
 
298 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1209  ubiquinol oxidase, subunit II  35.36 
 
 
295 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0864701  normal  0.353676 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1001  cytochrome c oxidase polypeptide II  35.88 
 
 
310 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6006  ubiquinol oxidase, subunit II  35.36 
 
 
295 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  35.36 
 
 
295 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1295  ubiquinol oxidase, subunit II  35.36 
 
 
295 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833627  hitchhiker  0.00150484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0042  ubiquinol oxidase, subunit II  38.02 
 
 
341 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2090  ubiquinol oxidase, subunit II  36.4 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1548  ubiquinol oxidase, subunit II  35.5 
 
 
350 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.18234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4890  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  36.51 
 
 
345 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3795  ubiquinol oxidase, subunit II  36.95 
 
 
301 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3163  ubiquinol oxidase, subunit II  36.84 
 
 
320 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193741 
 
 
-
 
NC_004310  BR0042  ubiquinol oxidase, subunit II  37.6 
 
 
341 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5735  ubiquinol oxidase, subunit II  36.98 
 
 
426 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5376  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  35.63 
 
 
283 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2814  ubiquinol oxidase, subunit II  36.63 
 
 
340 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0603  ubiquinol oxidase, subunit II  37.1 
 
 
296 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2772  ubiquinol oxidase, subunit II  37.1 
 
 
296 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2833  ubiquinol oxidase polypeptide II precursor  37.1 
 
 
296 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2410  ubiquinol oxidase, subunit II  37.25 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1722  ubiquinol oxidase, subunit II  37.25 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2880  ubiquinol oxidase, subunit II  37.25 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1877  ubiquinol oxidase, subunit II  34.73 
 
 
350 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1744  putative cytochrome o ubiquinol oxidase chain II protein  35.77 
 
 
343 aa  152  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195887  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2714  ubiquinol oxidase, subunit II  36.69 
 
 
296 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218735  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0194  ubiquinol oxidase, subunit II  36.09 
 
 
300 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1369  ubiquinol oxidase, subunit II  36.09 
 
 
300 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  35.34 
 
 
299 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4376  ubiquinol oxidase, subunit II  38.46 
 
 
314 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.918748  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2572  ubiquinol oxidase, subunit II  36.23 
 
 
330 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1566  ubiquinol oxidase, subunit II  36.23 
 
 
295 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0225  ubiquinol oxidase, subunit II  36.23 
 
 
295 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1275  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  36.22 
 
 
323 aa  151  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000390058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1141  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  36.07 
 
 
313 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408263 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2716  ubiquinol oxidase, subunit II  35.85 
 
 
330 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0993  ubiquinol oxidase, subunit II  35.71 
 
 
300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0479  ubiquinol oxidase, subunit II  36.33 
 
 
295 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1788  ubiquinol oxidase, subunit II  35.66 
 
 
377 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0548313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0501  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.36 
 
 
318 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000104856  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  33.93 
 
 
300 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0545  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.36 
 
 
309 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00734942  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0484  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.36 
 
 
318 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000643315  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0482  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.36 
 
 
309 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0954  ubiquinol oxidase, subunit II  32.94 
 
 
302 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5608  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  34.7 
 
 
349 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0812  ubiquinol oxidase subunit 2  38.18 
 
 
313 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.642349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0835  ubiquinol oxidase, subunit II  38.18 
 
 
313 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0490  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.36 
 
 
318 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000373186  hitchhiker  0.00204632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1325  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  36.56 
 
 
313 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4778  ubiquinol oxidase, subunit II  36.29 
 
 
385 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213947  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3649  ubiquinol oxidase, subunit II  34.75 
 
 
299 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0849  ubiquinol oxidase, subunit II  37.82 
 
 
313 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00009  ubiquinol oxidase, subunit II  36.48 
 
 
311 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.829439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 
349 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00383  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  38.4 
 
 
315 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000068734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3201  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  38.4 
 
 
315 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  hitchhiker  0.0000824271 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00387  hypothetical protein  38.4 
 
 
315 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000137293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0467  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  38.4 
 
 
315 aa  148  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0354  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  38.4 
 
 
315 aa  148  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0519619  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0507  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  38.4 
 
 
315 aa  148  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.47547e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0741  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  38.43 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.586473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1858  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  35.74 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.2499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4579  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  33.83 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4372  ubiquinol oxidase, subunit II  35.6 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0656  ubiquinol oxidase, subunit II  38.43 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3177  ubiquinol oxidase, subunit II  38.4 
 
 
315 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 
349 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0472  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  38.4 
 
 
315 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304701  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  36.55 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  36.55 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  36.55 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  36.55 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1290  ubiquinol oxidase, subunit II  36.94 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  36.55 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  36.55 
 
 
349 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  36.55 
 
 
349 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3858  ubiquinol oxidase, subunit II  37.65 
 
 
347 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  36.55 
 
 
349 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4146  ubiquinol oxidase, subunit II  37.25 
 
 
367 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0516  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  38 
 
 
315 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162933  normal  0.952162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>