More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3632 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  100 
 
 		 444 aa  906    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  75.64 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  62.22 
 
 		 382 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  62.22 
 
 		 382 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  63.82 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  62.18 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  62.18 
 
 		 382 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  63.42 
 
 		 384 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  59.9 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  60.1 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  62.41 
 
 		 269 aa  356  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  59.02 
 
 		 273 aa  342  7e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  56.44 
 
 		 280 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  55.16 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  55.2 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  55.43 
 
 		 272 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  54.55 
 
 		 272 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  45.86 
 
 		 271 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  31.08 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.82 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32.52 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  31.78 
 
 		 350 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  29.08 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  29.78 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.13 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  31.61 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.61 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.04 
 
 		 337 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  30.88 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  27.82 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  32.27 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  30.49 
 
 		 337 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  36.78 
 
 		 353 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  32.78 
 
 		 310 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  30.87 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  29.81 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  31.93 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  32.12 
 
 		 313 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  32.58 
 
 		 373 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  28.07 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.68 
 
 		 288 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  32.18 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  27.06 
 
 		 358 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  27.4 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  31.6 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  30.18 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  28.53 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  29.9 
 
 		 362 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  31.02 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  30.14 
 
 		 347 aa  149  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  27.37 
 
 		 329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  27.51 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.2 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.27 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  33.83 
 
 		 267 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  28.41 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  28.12 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  25.92 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  27.3 
 
 		 344 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.57 
 
 		 370 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.25 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  27.89 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  29.9 
 
 		 318 aa  106  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  26.5 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0515  cytochrome c class I  42.59 
 
 		 176 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  26.94 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  26.26 
 
 		 356 aa  103  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  30.3 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  30.43 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.04 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  29.88 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  26.34 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  25.7 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  29.08 
 
 		 352 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.77 
 
 		 291 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  26.7 
 
 		 211 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  28.39 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 		 373 aa  97.8  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  27.44 
 
 		 330 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  25.78 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  26.26 
 
 		 371 aa  97.8  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  25.07 
 
 		 389 aa  97.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  42.55 
 
 		 351 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  27.06 
 
 		 353 aa  96.7  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  25.67 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  25.67 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  26.89 
 
 		 243 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  26 
 
 		 531 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  23.98 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  25.67 
 
 		 532 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.82 
 
 		 270 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  27.54 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  25.48 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  28.43 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  24.33 
 
 		 532 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>