More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4435 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  100 
 
 		 316 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  47.42 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  46.67 
 
 		 314 aa  295  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  49.67 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  46.75 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  48.38 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  45.67 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  40.44 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  44.67 
 
 		 362 aa  279  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  45 
 
 		 362 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  45.57 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  44.1 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  41.5 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  42.09 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  40.67 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  37.67 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  38.36 
 
 		 300 aa  205  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  47.85 
 
 		 211 aa  202  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  36.45 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  36.14 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  39.87 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  36.96 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  38.59 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  35.83 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  35.83 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.47 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  38.16 
 
 		 426 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  36.99 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  37.46 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  39.25 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  33.53 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  36.77 
 
 		 399 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  38.63 
 
 		 337 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  36.62 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  34.16 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  34.41 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  31.09 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  31.64 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  31.64 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  29.94 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  30.25 
 
 		 382 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  30.25 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 		 388 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  28.93 
 
 		 384 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  27.54 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  28.93 
 
 		 444 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.75 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 334 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  33.06 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.43 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 		 367 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  31.98 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  31.18 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  33.06 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.58 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  31.43 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.17 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.69 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  31.84 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  31.5 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  34.67 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  28.9 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  33.61 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.09 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.58 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  27.65 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.09 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.24 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  29.84 
 
 		 321 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.23 
 
 		 371 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  33.2 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  29.75 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  47.37 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  29.46 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  29.94 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  31.9 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  32.32 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  41.32 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  30.68 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  31.56 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  28.99 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  33.05 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  29.78 
 
 		 249 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  25.86 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  46.36 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  35.2 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  31.2 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  35.26 
 
 		 330 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  34.07 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  29.9 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.42 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  26.29 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.65 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  31.03 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  26.86 
 
 		 513 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>