More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1348 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  100 
 
 		 426 aa  876    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  67.5 
 
 		 405 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  58.09 
 
 		 408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  54.95 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  50.34 
 
 		 302 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  46.15 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  45.87 
 
 		 318 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  45 
 
 		 301 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  46.98 
 
 		 288 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.35 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  36.21 
 
 		 329 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  36.2 
 
 		 330 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  37.03 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  36.95 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  38.16 
 
 		 316 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  35.64 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  35.64 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  36.03 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  35.02 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  33.86 
 
 		 358 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 314 aa  183  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  40.07 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  40.07 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  38.65 
 
 		 337 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  37.79 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  34.42 
 
 		 362 aa  177  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  33.93 
 
 		 389 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  33.44 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  30.64 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  30.64 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  35.81 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  32.31 
 
 		 318 aa  166  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  35.92 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  29.31 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  29.12 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  28.92 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  31.95 
 
 		 321 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  29.89 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  29.74 
 
 		 394 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  29.59 
 
 		 444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  27.79 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  40.52 
 
 		 211 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.49 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  29.51 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  30.69 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  29.91 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.25 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  28.48 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  30.94 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  32.18 
 
 		 279 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  30.42 
 
 		 280 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  26.22 
 
 		 304 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  28.98 
 
 		 321 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  27.95 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  26.55 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.4 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  26.29 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  30.04 
 
 		 272 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  24.57 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.87 
 
 		 243 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  28.7 
 
 		 308 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  31.07 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  27.75 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  24.16 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  24.16 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  27.31 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  26.26 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  27.03 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  28.7 
 
 		 272 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  25.44 
 
 		 385 aa  103  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  25.47 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  25.47 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  25.47 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  25.47 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  25.47 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  25.75 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  25.47 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  25.47 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  28.7 
 
 		 336 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  26.6 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  24.34 
 
 		 532 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  30.99 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  27.43 
 
 		 315 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  29.04 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  24.34 
 
 		 532 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  30.04 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  30.36 
 
 		 279 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  40.52 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  27.48 
 
 		 255 aa  101  3e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.36 
 
 		 279 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>