More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1538 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
399 aa  829    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  57.53 
 
 
408 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  54.95 
 
 
426 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  52.61 
 
 
405 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  46.02 
 
 
300 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  46.62 
 
 
301 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  46.15 
 
 
302 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  43.4 
 
 
318 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  44.56 
 
 
288 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.27 
 
 
311 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  36.27 
 
 
329 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
330 aa  205  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  35.91 
 
 
316 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  34.73 
 
 
342 aa  199  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  34.8 
 
 
330 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  37.04 
 
 
358 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  39.87 
 
 
337 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  39.74 
 
 
337 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  36.42 
 
 
362 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  39.74 
 
 
337 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  37.01 
 
 
362 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  35.49 
 
 
351 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  35.8 
 
 
362 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  33.95 
 
 
350 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  33.95 
 
 
350 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.95 
 
 
350 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.77 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  35.48 
 
 
310 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  32.69 
 
 
314 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 
313 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 
359 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  32.45 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  33.94 
 
 
389 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  33.99 
 
 
318 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.94 
 
 
321 aa  160  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  30.42 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  30.42 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  28.85 
 
 
384 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  27.99 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  27.99 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  27.61 
 
 
394 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  27.37 
 
 
391 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  26.38 
 
 
388 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  29.04 
 
 
384 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  31.97 
 
 
344 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.68 
 
 
211 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  30.51 
 
 
418 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  25.35 
 
 
444 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  30.51 
 
 
418 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 
304 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  25.61 
 
 
538 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 
405 aa  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  25.34 
 
 
544 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  32.74 
 
 
275 aa  122  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  24.43 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 
273 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 
525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  23.96 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 
525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 
517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 
517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 
517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 
525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  26.01 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  33.68 
 
 
243 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  25.27 
 
 
525 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  29.34 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  23.96 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  23.71 
 
 
385 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  23.96 
 
 
532 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  32.74 
 
 
276 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  26.55 
 
 
557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  23.96 
 
 
531 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  26.84 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  29.24 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  34.68 
 
 
311 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  27.31 
 
 
525 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  31.86 
 
 
255 aa  116  7.999999999999999e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  26.97 
 
 
370 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  26.52 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  27.57 
 
 
524 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  26.52 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  27.99 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  27.99 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  34.86 
 
 
290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  28.38 
 
 
390 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.31 
 
 
274 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  23.93 
 
 
373 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  24.29 
 
 
389 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  29.69 
 
 
303 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  28.57 
 
 
398 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  25.65 
 
 
535 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  25.65 
 
 
535 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  29.58 
 
 
292 aa  113  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  31.53 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  31.34 
 
 
272 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  25.86 
 
 
421 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  31.12 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  24.31 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>