More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1380 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
389 aa  806    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  82.78 
 
 
389 aa  697    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  82.99 
 
 
390 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  82.78 
 
 
389 aa  697    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  78.34 
 
 
380 aa  628  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  79.12 
 
 
392 aa  614  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  76.61 
 
 
400 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  76.06 
 
 
401 aa  594  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  75.68 
 
 
398 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  75.96 
 
 
388 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  70.5 
 
 
402 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  65.3 
 
 
421 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  65.09 
 
 
422 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  64.5 
 
 
418 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  64.5 
 
 
418 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  62.26 
 
 
385 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  60.87 
 
 
538 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  62.53 
 
 
385 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  60.61 
 
 
544 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  63.09 
 
 
390 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  60.05 
 
 
557 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  58.97 
 
 
532 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  58.97 
 
 
525 aa  474  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
532 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
532 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
532 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
525 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
517 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
525 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
525 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
525 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  58.72 
 
 
531 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
517 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
517 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  58.46 
 
 
535 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  58.46 
 
 
535 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  54.52 
 
 
377 aa  401  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  54.52 
 
 
377 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  50.56 
 
 
382 aa  352  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  49 
 
 
374 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  48.17 
 
 
373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  47.16 
 
 
524 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  48.01 
 
 
513 aa  328  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  45.79 
 
 
519 aa  328  9e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  43.58 
 
 
401 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  43.58 
 
 
401 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  45.04 
 
 
523 aa  322  7e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  46.26 
 
 
528 aa  322  8e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  46.88 
 
 
524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  43.14 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  43.79 
 
 
366 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  43.2 
 
 
374 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  48.87 
 
 
521 aa  319  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  45.2 
 
 
375 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  45.2 
 
 
375 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  46.59 
 
 
520 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  45.51 
 
 
375 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  45.56 
 
 
375 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  45.38 
 
 
513 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  44.78 
 
 
513 aa  316  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  45.2 
 
 
375 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  44.78 
 
 
513 aa  315  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  44.82 
 
 
513 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  45 
 
 
512 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  41.27 
 
 
387 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  44.72 
 
 
518 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  45.56 
 
 
518 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  44.72 
 
 
518 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  44.13 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  44.07 
 
 
511 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  42.54 
 
 
384 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  44.72 
 
 
518 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  42.41 
 
 
378 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  43.3 
 
 
356 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  43.18 
 
 
385 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  41.67 
 
 
388 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  42.58 
 
 
377 aa  279  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  38.92 
 
 
401 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  48.58 
 
 
311 aa  265  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  37.12 
 
 
380 aa  242  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  45.8 
 
 
281 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  46.34 
 
 
320 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  43.73 
 
 
308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  40.87 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  39.62 
 
 
304 aa  196  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  38.08 
 
 
304 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  39.84 
 
 
295 aa  186  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  37.72 
 
 
303 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  38.1 
 
 
284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  42.62 
 
 
294 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  39.38 
 
 
303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  39.38 
 
 
303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  41.15 
 
 
284 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  37.13 
 
 
287 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  37.97 
 
 
294 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  39.26 
 
 
284 aa  180  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  40.5 
 
 
343 aa  180  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  39.92 
 
 
270 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0642  cytochrome c oxidase, subunit II  38.06 
 
 
294 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.439468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  39.52 
 
 
279 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>