More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0614 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
303 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  90.1 
 
 
303 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  89.77 
 
 
303 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  62.99 
 
 
304 aa  354  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  62.26 
 
 
270 aa  323  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4321  cytochrome-c oxidase  57.81 
 
 
298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018888  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  57.65 
 
 
320 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  48.12 
 
 
284 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  49.22 
 
 
284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  45.56 
 
 
304 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  46.46 
 
 
255 aa  239  5e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  44.74 
 
 
285 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  44.74 
 
 
285 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  44.26 
 
 
279 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 
285 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  47.83 
 
 
303 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  50.43 
 
 
279 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  47.41 
 
 
279 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  46.07 
 
 
285 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  44.18 
 
 
292 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  50.87 
 
 
279 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 
279 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 
279 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  49.2 
 
 
288 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  46.27 
 
 
285 aa  221  9e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  46.27 
 
 
285 aa  221  9e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4648  cytochrome c oxidase subunit II  46.25 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5298  normal  0.167898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4787  cytochrome-c oxidase  46.54 
 
 
284 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  43.7 
 
 
294 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  43.16 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  44.87 
 
 
294 aa  212  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  44.36 
 
 
343 aa  212  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3875  cytochrome c oxidase, subunit II  45.88 
 
 
338 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0642  cytochrome c oxidase, subunit II  44.49 
 
 
294 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.439468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  38.89 
 
 
380 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  45.64 
 
 
284 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  40.83 
 
 
287 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1039  cytochrome c oxidase subunit II  42.5 
 
 
312 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  41.53 
 
 
400 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0602  cytochrome c oxidase, subunit II  44.88 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  37.72 
 
 
389 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.68 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  38.34 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  38.28 
 
 
254 aa  196  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  36.17 
 
 
422 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  36.91 
 
 
389 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  37.72 
 
 
389 aa  195  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  39.08 
 
 
390 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  38.46 
 
 
390 aa  192  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  37.12 
 
 
418 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  37.69 
 
 
398 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
418 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  36.75 
 
 
402 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  38.37 
 
 
401 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  37.02 
 
 
557 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  37.78 
 
 
385 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  37.81 
 
 
388 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1002  cytochrome c oxidase, subunit II  38.28 
 
 
257 aa  186  5e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0913  cytochrome-c oxidase  41.96 
 
 
349 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  37.13 
 
 
538 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  41.03 
 
 
401 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  41.03 
 
 
401 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0809  cytochrome-c oxidase  37.21 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  38.34 
 
 
525 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  38.34 
 
 
525 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  38.34 
 
 
525 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  38.34 
 
 
525 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  39.24 
 
 
392 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  38.34 
 
 
517 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  38.34 
 
 
517 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 
532 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 
532 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 
532 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  38.34 
 
 
517 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  35.87 
 
 
544 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 
531 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 
525 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  34.74 
 
 
532 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  37.41 
 
 
320 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  38.7 
 
 
513 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  39.68 
 
 
311 aa  175  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  38.11 
 
 
373 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  38.56 
 
 
524 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  37.61 
 
 
512 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 
519 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  35.98 
 
 
513 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  37.18 
 
 
520 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  38.26 
 
 
524 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 
535 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  37.02 
 
 
518 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 
535 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  35.56 
 
 
513 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  35.83 
 
 
518 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  36.29 
 
 
518 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  37.45 
 
 
511 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  34.71 
 
 
513 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  36.6 
 
 
518 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  35.15 
 
 
513 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  37.23 
 
 
521 aa  168  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  37.92 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>