More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0581 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
294 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  90.49 
 
 
284 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  71.89 
 
 
287 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  73.21 
 
 
294 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0642  cytochrome c oxidase, subunit II  63.12 
 
 
294 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.439468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1039  cytochrome c oxidase subunit II  64.23 
 
 
312 aa  352  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0602  cytochrome c oxidase, subunit II  63.41 
 
 
294 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  57.71 
 
 
284 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  54.65 
 
 
284 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  52.47 
 
 
279 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4648  cytochrome c oxidase subunit II  57.02 
 
 
286 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5298  normal  0.167898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  57.85 
 
 
285 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  49.4 
 
 
303 aa  254  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  54.62 
 
 
343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  53.28 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  48.47 
 
 
279 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4787  cytochrome-c oxidase  55.97 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  46.99 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  49.64 
 
 
285 aa  242  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  49.64 
 
 
285 aa  242  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  50.76 
 
 
292 aa  242  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  44.64 
 
 
279 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  44.64 
 
 
279 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3875  cytochrome c oxidase, subunit II  51.85 
 
 
338 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  49.6 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  44.64 
 
 
279 aa  238  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  51.18 
 
 
285 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  51.18 
 
 
285 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  47.06 
 
 
255 aa  233  3e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  47.69 
 
 
270 aa  232  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  51.6 
 
 
279 aa  231  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  49.59 
 
 
285 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4321  cytochrome-c oxidase  50.21 
 
 
298 aa  224  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018888  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  42.81 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  43.2 
 
 
254 aa  216  5e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  45.38 
 
 
303 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  45.38 
 
 
303 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  44.87 
 
 
303 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0913  cytochrome-c oxidase  48.95 
 
 
349 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  39.38 
 
 
422 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  42.86 
 
 
418 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  44.86 
 
 
320 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  42.86 
 
 
418 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0809  cytochrome-c oxidase  42.35 
 
 
247 aa  202  4e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1002  cytochrome c oxidase, subunit II  43.03 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  42.86 
 
 
390 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  42.28 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  40.17 
 
 
385 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  40.3 
 
 
421 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  40.38 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  39.57 
 
 
385 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 
532 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  37.99 
 
 
532 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  37.99 
 
 
532 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  37.99 
 
 
532 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  41.41 
 
 
385 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  37.99 
 
 
531 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  37.93 
 
 
377 aa  192  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  38.41 
 
 
525 aa  191  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  38.87 
 
 
389 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  39.85 
 
 
390 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  37.22 
 
 
401 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 
535 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  38.65 
 
 
377 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  38.82 
 
 
521 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  38.82 
 
 
513 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  38.11 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 
535 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  41.38 
 
 
374 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  38.91 
 
 
380 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  39.09 
 
 
373 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  40.53 
 
 
389 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  40.09 
 
 
374 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  37.41 
 
 
544 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  38.91 
 
 
538 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  37.16 
 
 
557 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  39.91 
 
 
366 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  36.63 
 
 
524 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  35.55 
 
 
398 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  39.27 
 
 
375 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  38.78 
 
 
316 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  37.77 
 
 
375 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  37.05 
 
 
375 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  37.15 
 
 
400 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  37.1 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  39.36 
 
 
518 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  39.36 
 
 
518 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  38.13 
 
 
524 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  39.36 
 
 
518 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  39.36 
 
 
518 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  38.46 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  38.76 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  39.39 
 
 
375 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  35.63 
 
 
523 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  37.9 
 
 
525 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  37.9 
 
 
525 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  37.9 
 
 
525 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
513 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  37.9 
 
 
517 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  38.36 
 
 
378 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>