More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0913 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0913  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 349 aa  693    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214333  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  63.08 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3875  cytochrome c oxidase, subunit II  59.09 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  47.64 
 
 		 292 aa  245  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  49.36 
 
 		 304 aa  242  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  46.78 
 
 		 279 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  49.58 
 
 		 284 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  46.58 
 
 		 303 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  50.19 
 
 		 285 aa  227  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  50.19 
 
 		 285 aa  227  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  53.85 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  53.85 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4648  cytochrome c oxidase subunit II  52.44 
 
 		 286 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5298  normal  0.167898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  51.93 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  48.28 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  48.77 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  48.95 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  45.62 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  46.01 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  51.9 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  45.41 
 
 		 287 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  46.72 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4787  cytochrome-c oxidase  48.54 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1039  cytochrome c oxidase subunit II  44.7 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  46.15 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  46.19 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  46.19 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  48.26 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  49.46 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4321  cytochrome-c oxidase  43.75 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0809  cytochrome-c oxidase  45.36 
 
 		 247 aa  192  6e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  44.33 
 
 		 279 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  41.96 
 
 		 303 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0642  cytochrome c oxidase, subunit II  43.57 
 
 		 294 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.439468 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  41.23 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1002  cytochrome c oxidase, subunit II  42.86 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  42.17 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  40 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  40 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  38.7 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0602  cytochrome c oxidase, subunit II  43.62 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  40.65 
 
 		 270 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  41.9 
 
 		 513 aa  169  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  40.91 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  40.76 
 
 		 513 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  38.39 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  40.28 
 
 		 513 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  40.28 
 
 		 513 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  40.23 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  40.09 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  43.81 
 
 		 385 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  38.68 
 
 		 524 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  36.18 
 
 		 373 aa  162  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  39.42 
 
 		 518 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  40.08 
 
 		 281 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  40.1 
 
 		 518 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  40.1 
 
 		 518 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  40.1 
 
 		 518 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  40 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  38.68 
 
 		 524 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  41.59 
 
 		 377 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  40.49 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  34.45 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  36.09 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  37.95 
 
 		 401 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  37.95 
 
 		 401 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  37.72 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  38.54 
 
 		 375 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  36.65 
 
 		 521 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 		 513 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  35.81 
 
 		 380 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  39.51 
 
 		 374 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  37.67 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  37.67 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 		 528 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  33.48 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  37.07 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  36.33 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  35.53 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  32.73 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  36.59 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  36.1 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  38.01 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  35.61 
 
 		 375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  33.19 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.61 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  33.77 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  33.48 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  34.78 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  42 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  35.85 
 
 		 511 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  32.41 
 
 		 390 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 		 418 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 		 418 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  30.8 
 
 		 422 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  35.89 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  35.16 
 
 		 519 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>