More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0293 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 311 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  58.62 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  54.26 
 
 		 519 aa  311  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  53.36 
 
 		 405 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  61.18 
 
 		 384 aa  305  7e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  56.05 
 
 		 387 aa  302  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  52.83 
 
 		 524 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  55.17 
 
 		 513 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  54.44 
 
 		 524 aa  298  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  56.54 
 
 		 377 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  57.38 
 
 		 528 aa  295  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  57.92 
 
 		 523 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  58.47 
 
 		 513 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  58.23 
 
 		 513 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  57.89 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  56.12 
 
 		 377 aa  292  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  57.81 
 
 		 513 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  57.81 
 
 		 513 aa  292  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  54.81 
 
 		 512 aa  291  9e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  55.08 
 
 		 366 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  56.78 
 
 		 518 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  56.78 
 
 		 518 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  54.3 
 
 		 374 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  56.54 
 
 		 520 aa  289  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  55.7 
 
 		 375 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  56.84 
 
 		 518 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  56.84 
 
 		 518 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  55.27 
 
 		 375 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  55.27 
 
 		 511 aa  287  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  52.36 
 
 		 521 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  54.62 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  54.85 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  52.65 
 
 		 374 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  55.47 
 
 		 385 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  54.85 
 
 		 375 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  58.01 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  52.51 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  53.56 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  53.56 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  51.5 
 
 		 281 aa  275  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  47.31 
 
 		 557 aa  275  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  56.9 
 
 		 356 aa  275  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  47.69 
 
 		 525 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  52.97 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  50.63 
 
 		 320 aa  268  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  46.54 
 
 		 544 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  49.22 
 
 		 385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  46.92 
 
 		 531 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  46.92 
 
 		 532 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  46.15 
 
 		 538 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  46.92 
 
 		 532 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  46.92 
 
 		 532 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  46.15 
 
 		 532 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  49.37 
 
 		 525 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  49.37 
 
 		 525 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  49.37 
 
 		 525 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  49.37 
 
 		 517 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  49.37 
 
 		 517 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  48.58 
 
 		 389 aa  265  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  49.37 
 
 		 525 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  49.37 
 
 		 517 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  49.39 
 
 		 385 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  46.3 
 
 		 421 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  49.37 
 
 		 388 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  43.67 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  50.21 
 
 		 418 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  50.21 
 
 		 418 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  47.31 
 
 		 535 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  47.31 
 
 		 535 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  50.21 
 
 		 390 aa  258  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  45.72 
 
 		 422 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  46.55 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  48.16 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  46.91 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  49.42 
 
 		 390 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  45.35 
 
 		 380 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  50.85 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  47.28 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  47.37 
 
 		 377 aa  248  7e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  48.06 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  47.64 
 
 		 400 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  46.85 
 
 		 401 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  38.21 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  42.44 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  39.18 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  40.87 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  40.87 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  39.44 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  38.76 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  36.96 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  49.73 
 
 		 285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  36.69 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  39.84 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  35.51 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  39.38 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  36.4 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  38.93 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  37.13 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>