More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1038 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
388 aa  795    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  61.68 
 
 
387 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  62.29 
 
 
384 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  61.45 
 
 
523 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  60.34 
 
 
519 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  62.32 
 
 
520 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  63.17 
 
 
518 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  60.29 
 
 
524 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  62.61 
 
 
518 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  59.13 
 
 
528 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  62.32 
 
 
518 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  61.67 
 
 
513 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  61.71 
 
 
524 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  61.11 
 
 
513 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  59.62 
 
 
513 aa  454  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  62.61 
 
 
518 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  61.11 
 
 
513 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  61.94 
 
 
513 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  58.96 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  61.81 
 
 
375 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  59.77 
 
 
512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  60.91 
 
 
521 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  60 
 
 
511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  60.87 
 
 
375 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  61.16 
 
 
375 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  60.87 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  60.29 
 
 
375 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  56.16 
 
 
366 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  59.14 
 
 
356 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  60.64 
 
 
374 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  56.44 
 
 
374 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  63.19 
 
 
385 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  59.54 
 
 
374 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  51.49 
 
 
373 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  49.46 
 
 
401 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  49.46 
 
 
401 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  52.12 
 
 
377 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  51.56 
 
 
377 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  50.97 
 
 
378 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  53.04 
 
 
382 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  47.54 
 
 
377 aa  338  8e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  45.78 
 
 
421 aa  338  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  44.41 
 
 
422 aa  336  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  44.47 
 
 
544 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  47.37 
 
 
401 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  43.94 
 
 
557 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  44.65 
 
 
525 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  44.47 
 
 
538 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  43.94 
 
 
532 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  46.37 
 
 
390 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  43.94 
 
 
532 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  43.94 
 
 
532 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  43.94 
 
 
532 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  43.94 
 
 
531 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  44.78 
 
 
525 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  44.78 
 
 
517 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  44.78 
 
 
517 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  44.78 
 
 
525 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  44.78 
 
 
525 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  44.78 
 
 
517 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  44.78 
 
 
525 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  44.51 
 
 
418 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  44.51 
 
 
418 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  43.4 
 
 
535 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  43.4 
 
 
535 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  43.73 
 
 
385 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  55.65 
 
 
281 aa  306  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  41.62 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  43.49 
 
 
380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  42.41 
 
 
388 aa  303  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  42.42 
 
 
389 aa  301  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  42.42 
 
 
389 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  43.01 
 
 
390 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  40.4 
 
 
398 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  42.09 
 
 
389 aa  299  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  57.03 
 
 
311 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  39.38 
 
 
402 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  39.51 
 
 
392 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  40.81 
 
 
400 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  42.93 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  39.47 
 
 
380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  49.38 
 
 
308 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  45.91 
 
 
320 aa  240  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  38.31 
 
 
284 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  41.3 
 
 
255 aa  182  8.000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  39.29 
 
 
284 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  37.01 
 
 
304 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  38.93 
 
 
287 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  40.98 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  45.45 
 
 
285 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  40.96 
 
 
285 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  40.96 
 
 
285 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  46.67 
 
 
343 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  41.07 
 
 
294 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  39.76 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  39.76 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  38.22 
 
 
294 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  43.43 
 
 
279 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  36.29 
 
 
292 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4787  cytochrome-c oxidase  38.63 
 
 
284 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>