More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2167 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 316 aa  649    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  41.46 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4648  cytochrome c oxidase subunit II  44.95 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5298  normal  0.167898 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  40.59 
 
 		 255 aa  192  7e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  38.72 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  38.49 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  39.15 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  39.74 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  38.78 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  37.28 
 
 		 279 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  39.59 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  36.26 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1039  cytochrome c oxidase subunit II  36.81 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4787  cytochrome-c oxidase  38.85 
 
 		 284 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  37.92 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  37.92 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0913  cytochrome-c oxidase  42.17 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  36.76 
 
 		 294 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  36.7 
 
 		 279 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0642  cytochrome c oxidase, subunit II  37.55 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.439468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  37.39 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  37.39 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  34.91 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4321  cytochrome-c oxidase  39.06 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0899  cytochrome c oxidase, subunit II  39.76 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  38.66 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0602  cytochrome c oxidase, subunit II  37.55 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  35.04 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  38.66 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  37.25 
 
 		 295 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  37.5 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0809  cytochrome-c oxidase  36.29 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1002  cytochrome c oxidase, subunit II  36.29 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  35.6 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  35.6 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  33.56 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  35.62 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  36.07 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3875  cytochrome c oxidase, subunit II  36.65 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  33.21 
 
 		 279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  34.08 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  34.08 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  35.27 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 		 513 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  37.17 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  36.56 
 
 		 513 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  31.29 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  36.56 
 
 		 513 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  38.6 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  35.32 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  35.32 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  35.19 
 
 		 375 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  36.44 
 
 		 518 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  33.46 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 518 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  34.04 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 		 512 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  36.32 
 
 		 518 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  33.77 
 
 		 405 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  33.62 
 
 		 375 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  36.32 
 
 		 518 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  36.19 
 
 		 524 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  33.19 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  34.88 
 
 		 270 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  33.05 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  34.22 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  32.91 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  34.1 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  34.94 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  34.96 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 528 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  32.59 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  31.85 
 
 		 525 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  30.45 
 
 		 557 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  31.74 
 
 		 532 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  33.79 
 
 		 521 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 525 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 525 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 517 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  31.74 
 
 		 531 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 517 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 525 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  31.74 
 
 		 532 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 517 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  30.5 
 
 		 389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 		 525 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  31.74 
 
 		 532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  34.11 
 
 		 524 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  33.18 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  35.21 
 
 		 513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  29.8 
 
 		 544 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  31.75 
 
 		 532 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 		 511 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  32.48 
 
 		 535 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  32.48 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  30.29 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  29.72 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  30.89 
 
 		 387 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>