More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06421 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  72.59 
 
 
276 aa  411  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  69.26 
 
 
275 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  68.06 
 
 
291 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  64.66 
 
 
270 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  63.84 
 
 
270 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  59.19 
 
 
267 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  59.19 
 
 
267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  58.82 
 
 
267 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  61.51 
 
 
267 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  46.76 
 
 
324 aa  261  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  44.29 
 
 
336 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  45.65 
 
 
321 aa  254  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  47.21 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  47.21 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  39.33 
 
 
360 aa  247  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  44.13 
 
 
315 aa  237  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  41.49 
 
 
328 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  40.39 
 
 
355 aa  234  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  39.72 
 
 
339 aa  234  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  35.47 
 
 
308 aa  182  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.58 
 
 
304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  32.81 
 
 
302 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  34.81 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  54.24 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.68 
 
 
316 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  31.64 
 
 
344 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.61 
 
 
311 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  31.27 
 
 
299 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  33.74 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.75 
 
 
316 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  34.58 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  33.19 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  32.79 
 
 
337 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  32.77 
 
 
337 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  31.93 
 
 
337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  35.06 
 
 
342 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  29.66 
 
 
370 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.1 
 
 
367 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.53 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 
290 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  32.31 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  32.03 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  30.58 
 
 
329 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  48.11 
 
 
389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 
362 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 
243 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  30.43 
 
 
408 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  29.73 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  30.64 
 
 
269 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 
314 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  29.05 
 
 
256 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  29.6 
 
 
358 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  30.4 
 
 
426 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 
302 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  31.89 
 
 
271 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 
405 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  29.05 
 
 
314 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 
318 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 
330 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  29.6 
 
 
272 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  45.37 
 
 
313 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 
272 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 
300 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 
318 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  27.07 
 
 
311 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  44.44 
 
 
310 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  34.05 
 
 
350 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  32.79 
 
 
362 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  29.36 
 
 
321 aa  99.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  43.24 
 
 
362 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  30.58 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  27.87 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  31.67 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  33.57 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  39.67 
 
 
354 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  37.88 
 
 
350 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.2 
 
 
359 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  37.88 
 
 
350 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 
351 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  28.3 
 
 
349 aa  95.5  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  28.09 
 
 
347 aa  95.5  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.68 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  38.84 
 
 
338 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  39.13 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  26.76 
 
 
299 aa  94  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  30.51 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  30.51 
 
 
382 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  28.09 
 
 
384 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  30.58 
 
 
391 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  28.73 
 
 
355 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  42.4 
 
 
330 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  30.51 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  27.4 
 
 
359 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  39.5 
 
 
322 aa  92.4  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  41.07 
 
 
326 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  28.12 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>