More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3577 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  100 
 
 
311 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  79.66 
 
 
299 aa  494  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  51.23 
 
 
304 aa  291  9e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  48.8 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  48.52 
 
 
302 aa  271  9e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  44.18 
 
 
316 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  46.26 
 
 
308 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  39.05 
 
 
311 aa  205  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  39.34 
 
 
311 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  34.27 
 
 
276 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  32.32 
 
 
320 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  32.32 
 
 
320 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29 
 
 
355 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  30.85 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.61 
 
 
274 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.97 
 
 
291 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.6 
 
 
270 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.2 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.85 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.85 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  32.06 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  31.76 
 
 
275 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  29.11 
 
 
336 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.48 
 
 
267 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.07 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  26.85 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  28.94 
 
 
339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  29.59 
 
 
315 aa  126  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.58 
 
 
267 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.91 
 
 
316 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  29.68 
 
 
301 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 
318 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.9 
 
 
311 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  30.6 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  27.54 
 
 
318 aa  99  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  28.27 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  40.91 
 
 
351 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 
243 aa  95.5  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  24.71 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  26.75 
 
 
408 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 
342 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  26.72 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  28.22 
 
 
337 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.1 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 
399 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.38 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  28.84 
 
 
330 aa  90.1  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  27.12 
 
 
405 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  27.43 
 
 
337 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.39 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 
329 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  27.96 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  26.45 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  26.87 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  29.26 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  27.41 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  27.6 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  27.83 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  27.13 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  24.31 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  25.56 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  26.96 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  25.53 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  25.19 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  24.44 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.21 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  24.33 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  25.74 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 
286 aa  77  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  26.97 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  24.19 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  24.19 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  27.93 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  24.62 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4890  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  25.29 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0147207  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  30.34 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  35.71 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  31.14 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  22.79 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  26.61 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4600  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  23.2 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00365456  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  26.15 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  25.48 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  23.36 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  24.35 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  23.2 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  23.2 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  23.2 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  23.2 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  25 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  23.2 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  23.2 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1548  ubiquinol oxidase, subunit II  29.87 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.18234 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7135  ubiquinol oxidase, subunit II  25.25 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.959293  normal  0.391928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0737  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  23.2 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0350513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>