More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04431 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  100 
 
 
291 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  68.06 
 
 
274 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  68.68 
 
 
276 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  66.67 
 
 
270 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  66.3 
 
 
270 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  66.92 
 
 
275 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  61.94 
 
 
267 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  62.21 
 
 
267 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  62.59 
 
 
267 aa  328  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  63.85 
 
 
267 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  44.36 
 
 
324 aa  245  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  41.26 
 
 
336 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  40.64 
 
 
339 aa  241  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  42.8 
 
 
320 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  42.8 
 
 
320 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  40.65 
 
 
328 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  42.86 
 
 
321 aa  235  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  42.59 
 
 
315 aa  230  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  37.94 
 
 
360 aa  229  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.62 
 
 
355 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  36.76 
 
 
298 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  35.34 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  34.62 
 
 
308 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.89 
 
 
304 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  33.83 
 
 
316 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  51.72 
 
 
351 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  34.44 
 
 
311 aa  145  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  32.55 
 
 
299 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.97 
 
 
311 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 
344 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  33.73 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.84 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  29.53 
 
 
316 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.69 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.85 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  31.85 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  32.17 
 
 
337 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  33.17 
 
 
243 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.14 
 
 
367 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  33.47 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  31.75 
 
 
271 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.35 
 
 
370 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  32.64 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  32.63 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 
211 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  29.72 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  29.75 
 
 
318 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  32.1 
 
 
280 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 
382 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  32.61 
 
 
342 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  31.43 
 
 
382 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.51 
 
 
362 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  32.43 
 
 
285 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  27.2 
 
 
399 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  43.7 
 
 
310 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.26 
 
 
302 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  45.69 
 
 
313 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  29.77 
 
 
347 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  28.98 
 
 
269 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 
290 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  27.07 
 
 
408 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  32.64 
 
 
391 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 
330 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  48.04 
 
 
389 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  31.28 
 
 
362 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 
314 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  30.99 
 
 
394 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  30.45 
 
 
384 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  27.44 
 
 
358 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  30.77 
 
 
444 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  32.68 
 
 
384 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 
256 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  29.92 
 
 
362 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  28.45 
 
 
269 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  29.11 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  29.51 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  29.51 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 
388 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  27.95 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.43 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  27.39 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  29.01 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  31.16 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 
321 aa  95.9  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  27.05 
 
 
359 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  27.92 
 
 
350 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  27.92 
 
 
350 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  27.69 
 
 
289 aa  94  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  28.23 
 
 
249 aa  93.2  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  28.03 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  26.11 
 
 
426 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  24.92 
 
 
408 aa  92.4  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  27.5 
 
 
350 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.44 
 
 
288 aa  92  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  38.46 
 
 
334 aa  92  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  31.28 
 
 
324 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>