More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1779 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
339 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  59.33 
 
 
324 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  56.02 
 
 
321 aa  391  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  56.96 
 
 
336 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  48.19 
 
 
355 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  47.49 
 
 
328 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  44.23 
 
 
360 aa  337  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  46.41 
 
 
320 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  46.41 
 
 
320 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  48.08 
 
 
315 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  41.46 
 
 
351 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  42 
 
 
276 aa  258  9e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  41.45 
 
 
275 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  40.64 
 
 
291 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.72 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.59 
 
 
270 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  37.19 
 
 
270 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.55 
 
 
267 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.65 
 
 
267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.88 
 
 
267 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  38.57 
 
 
267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  32.36 
 
 
316 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 
308 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  32.74 
 
 
298 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.45 
 
 
304 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 
302 aa  162  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  31.64 
 
 
311 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  32.97 
 
 
337 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  33.09 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  32.73 
 
 
337 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.94 
 
 
311 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  27.48 
 
 
299 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
344 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.9 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  26.87 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  27.37 
 
 
243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  29.45 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  39.47 
 
 
211 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  28.92 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 
290 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  38.79 
 
 
316 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 
304 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  26.73 
 
 
347 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 
388 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 
324 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  26.55 
 
 
288 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 
304 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  38.52 
 
 
408 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  43.81 
 
 
313 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  30.2 
 
 
385 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 
385 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 
532 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 
532 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  25.94 
 
 
373 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 
402 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  27.14 
 
 
557 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 
418 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  28.42 
 
 
532 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  27.31 
 
 
370 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 
256 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 
418 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 
342 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  27.51 
 
 
289 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 
532 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  30.58 
 
 
405 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  25.88 
 
 
525 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  24.9 
 
 
300 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  42.02 
 
 
359 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  27.7 
 
 
531 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 
362 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  44.66 
 
 
389 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  28.33 
 
 
370 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  26.74 
 
 
525 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 
517 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  26.74 
 
 
525 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.51 
 
 
421 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 
517 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  26.74 
 
 
525 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  26.74 
 
 
525 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  36.13 
 
 
318 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 
517 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  27.13 
 
 
321 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  28.41 
 
 
314 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  26.67 
 
 
288 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  36.42 
 
 
326 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  41.9 
 
 
330 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  26.07 
 
 
302 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  25.29 
 
 
314 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  25.72 
 
 
382 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  27.47 
 
 
316 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  27.8 
 
 
304 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  27.61 
 
 
299 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  40.74 
 
 
362 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  40.16 
 
 
371 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  41.9 
 
 
362 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  26.55 
 
 
288 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  30.04 
 
 
422 aa  99.8  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  30.71 
 
 
401 aa  99.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 
535 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>