More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1522 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
330 aa  681    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  49.54 
 
 
329 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  50.78 
 
 
342 aa  323  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  45.96 
 
 
314 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  46.75 
 
 
316 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  45.54 
 
 
316 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  43.52 
 
 
318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  45.65 
 
 
310 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  43.83 
 
 
313 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  42.99 
 
 
350 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  42.99 
 
 
350 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  42.68 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  42.37 
 
 
359 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  43.03 
 
 
329 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  40.87 
 
 
362 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  41.49 
 
 
362 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  40.87 
 
 
362 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  43.08 
 
 
330 aa  259  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  39.63 
 
 
351 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  39.88 
 
 
321 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  41.19 
 
 
389 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  40.61 
 
 
337 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  40.61 
 
 
337 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  40.36 
 
 
337 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.29 
 
 
311 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  36.65 
 
 
408 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  37.72 
 
 
405 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  36.39 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  39.42 
 
 
301 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  35.65 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 
300 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  49.52 
 
 
211 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  36.2 
 
 
426 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  35.83 
 
 
288 aa  209  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  33.97 
 
 
399 aa  205  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 
318 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  33.53 
 
 
382 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  33.53 
 
 
382 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  31.81 
 
 
388 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  32.76 
 
 
382 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  32.76 
 
 
382 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
394 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  31.79 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  33.24 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  32.48 
 
 
384 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  30.53 
 
 
391 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 
390 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.5 
 
 
367 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  28.74 
 
 
370 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  30.12 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
402 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 
344 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  32.06 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  28.03 
 
 
389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
338 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 
517 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 
517 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 
517 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  27.49 
 
 
398 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  27.48 
 
 
544 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.19 
 
 
274 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 
531 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  28.34 
 
 
538 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  27.68 
 
 
389 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  27.68 
 
 
389 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  31.79 
 
 
525 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  28.62 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  28.23 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 
532 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 
532 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  28.21 
 
 
532 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  29.47 
 
 
557 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  27.14 
 
 
400 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  25.7 
 
 
388 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  27.86 
 
 
532 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  25.86 
 
 
380 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  34.69 
 
 
330 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  26.5 
 
 
385 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  33.21 
 
 
330 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  30.24 
 
 
334 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  30.22 
 
 
359 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  26.78 
 
 
401 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  28.38 
 
 
390 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.35 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  30.37 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  28.26 
 
 
349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  31.33 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.91 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  27.7 
 
 
387 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  34.31 
 
 
327 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  29.36 
 
 
354 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  28.13 
 
 
346 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  37.2 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  30.9 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  28.66 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>