More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12631 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
311 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  60.5 
 
 
311 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  42.27 
 
 
298 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  42.09 
 
 
316 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  38.59 
 
 
308 aa  228  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.87 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  40.57 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  38.36 
 
 
311 aa  202  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  41.49 
 
 
299 aa  193  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  32.97 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  32.97 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  32.58 
 
 
276 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.68 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.58 
 
 
270 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.71 
 
 
270 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
336 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  34.33 
 
 
321 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  30.36 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.85 
 
 
274 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  30.72 
 
 
328 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.33 
 
 
291 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  32.61 
 
 
315 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
316 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.34 
 
 
267 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.72 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.21 
 
 
267 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.56 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30 
 
 
316 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  31.28 
 
 
337 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  31.28 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  29.73 
 
 
329 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.2 
 
 
267 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  31.19 
 
 
302 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  31.7 
 
 
330 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 
318 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  28.05 
 
 
399 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  29.78 
 
 
318 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 
337 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
342 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  30.64 
 
 
358 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 
211 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  29.2 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  26.07 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  28.77 
 
 
289 aa  95.9  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  29.95 
 
 
301 aa  95.9  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  44.95 
 
 
351 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  27.83 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  41.12 
 
 
355 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  31.34 
 
 
304 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  36.72 
 
 
360 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  27.39 
 
 
269 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  27.62 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  32.6 
 
 
243 aa  89.7  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  26.24 
 
 
300 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  28.39 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  26.97 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  27.82 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  28.05 
 
 
405 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  28.29 
 
 
257 aa  87.4  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  29.22 
 
 
324 aa  87  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.29 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  27.57 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  27.68 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  26.39 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.52 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  30.28 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  30.15 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  26.94 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  29.46 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  30.09 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  35.66 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  25.9 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  27.56 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  29.5 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  34.97 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  28.44 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  36.04 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.99 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  28.96 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  26.34 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  34.97 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  31.37 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  33.33 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  32.35 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  26.1 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  26.1 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  32.35 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  29.46 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  29.58 
 
 
314 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  28.93 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  28.87 
 
 
272 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  29.71 
 
 
384 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  27.62 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  28.57 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  26.77 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>