More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2082 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
289 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  67.01 
 
 
299 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  63.95 
 
 
304 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  60.98 
 
 
299 aa  363  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  59.22 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  55.02 
 
 
288 aa  308  5.9999999999999995e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  51.23 
 
 
290 aa  298  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  51.52 
 
 
324 aa  295  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  51.94 
 
 
290 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  52.31 
 
 
304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  44.96 
 
 
286 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  42.16 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  42.46 
 
 
324 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  42.11 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  47.56 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  44.4 
 
 
288 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  46.69 
 
 
340 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  45.57 
 
 
265 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  41.54 
 
 
316 aa  208  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  42.62 
 
 
275 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  42.48 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  41.11 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  41.22 
 
 
323 aa  195  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  37.96 
 
 
269 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  39.66 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  37.16 
 
 
316 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  43.04 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  33.76 
 
 
398 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  32.52 
 
 
363 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  31 
 
 
366 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  32.25 
 
 
344 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  38.98 
 
 
315 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  31.51 
 
 
344 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  32.31 
 
 
519 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  31.5 
 
 
257 aa  132  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  32.73 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  30.45 
 
 
370 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  29.04 
 
 
523 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  27.73 
 
 
524 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  31.78 
 
 
375 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  32.09 
 
 
374 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 
281 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  33.49 
 
 
366 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 
513 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 
513 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 
513 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 
513 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  31.49 
 
 
375 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  31.6 
 
 
374 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  34.09 
 
 
311 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 
512 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 
528 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 
405 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  31.49 
 
 
375 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  29.55 
 
 
521 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  31.6 
 
 
375 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  33.19 
 
 
380 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  30.28 
 
 
320 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  32.55 
 
 
375 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  30.26 
 
 
524 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  28.95 
 
 
511 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  30.52 
 
 
385 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  29.26 
 
 
513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 
518 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 
520 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 
518 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 
518 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 
518 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 
387 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  31.05 
 
 
388 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  29.27 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  32.21 
 
 
401 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  32.21 
 
 
401 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  30.39 
 
 
374 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  32.7 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  33.5 
 
 
311 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  30.4 
 
 
377 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
377 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 
377 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  31.71 
 
 
382 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  30.65 
 
 
343 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  31.1 
 
 
378 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  26.75 
 
 
346 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  27.07 
 
 
422 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  27.11 
 
 
279 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  30.54 
 
 
326 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  40.48 
 
 
334 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 
402 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  30.56 
 
 
304 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  29.08 
 
 
287 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  31.75 
 
 
338 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  28.83 
 
 
389 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>