More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1874 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  39.67 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  39.09 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  35.87 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  35.87 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  35.87 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  32.1 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.62 
 
 		 316 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 314 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.29 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  32.09 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.83 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 336 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  29.84 
 
 		 315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  29.72 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.56 
 
 		 362 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.43 
 
 		 355 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  29.57 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  40.62 
 
 		 351 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  32.11 
 
 		 362 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  28.52 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.9 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  30.84 
 
 		 362 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  30.6 
 
 		 519 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  27.7 
 
 		 360 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 		 328 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.02 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.79 
 
 		 359 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  27.93 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.69 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  28.44 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  30.39 
 
 		 405 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  29.7 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  27.66 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  26.51 
 
 		 387 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  40 
 
 		 351 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  28.57 
 
 		 284 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  26.67 
 
 		 405 aa  99  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  28.35 
 
 		 373 aa  98.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  26.59 
 
 		 316 aa  98.6  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 		 513 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  29.25 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  26.86 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.86 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  30.71 
 
 		 294 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.88 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  28.45 
 
 		 524 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.12 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 		 374 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 		 313 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.12 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  26.21 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  26.98 
 
 		 408 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29.92 
 
 		 337 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  27.73 
 
 		 366 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  29.51 
 
 		 337 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.18 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  29.52 
 
 		 370 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  28.34 
 
 		 518 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  30.45 
 
 		 338 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  25.86 
 
 		 521 aa  95.9  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  27.54 
 
 		 528 aa  96.3  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 		 284 aa  95.9  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  30 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 		 310 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3177  ubiquinol oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 315 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0472  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  30.77 
 
 		 315 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  28.34 
 
 		 518 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00383  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  30.77 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000068734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  27.43 
 
 		 520 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 		 321 aa  94.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  26.18 
 
 		 374 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0354  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  30.77 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0519619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 		 513 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3201  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  30.77 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  hitchhiker  0.0000824271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  37.39 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0467  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  30.77 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0507  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  30.77 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.47547e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  27.85 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.31 
 
 		 513 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  31.82 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  38.02 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00387  hypothetical protein  30.77 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000137293  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 		 513 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0501  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  30.36 
 
 		 318 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000104856  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  30.7 
 
 		 337 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  27.31 
 
 		 513 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  26.1 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>