More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2602 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
315 aa  642    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  53.67 
 
 
321 aa  317  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  44.17 
 
 
355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  51.31 
 
 
324 aa  311  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 
328 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  49.16 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  48.19 
 
 
320 aa  301  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  48.19 
 
 
320 aa  301  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  48.08 
 
 
339 aa  295  8e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  42.9 
 
 
360 aa  293  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  45.7 
 
 
351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  47.12 
 
 
276 aa  258  7e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  42.86 
 
 
274 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  42.91 
 
 
291 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  40.97 
 
 
270 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  42.91 
 
 
275 aa  235  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  40.85 
 
 
270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.07 
 
 
267 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.07 
 
 
267 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.71 
 
 
267 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  39.64 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  32.07 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  34.25 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  34.52 
 
 
298 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.94 
 
 
304 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  30.66 
 
 
302 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  33.21 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  31.97 
 
 
299 aa  135  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  33.21 
 
 
337 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  31.78 
 
 
370 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  32.3 
 
 
311 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.85 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.8 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
311 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.1 
 
 
316 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  29.53 
 
 
316 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  30.64 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 
243 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  29.72 
 
 
211 aa  116  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.13 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  29.85 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  27.53 
 
 
329 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  31.89 
 
 
355 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  32.9 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  38.89 
 
 
326 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  28.68 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  30.86 
 
 
288 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1910  cytochrome c oxidase, subunit II  30.42 
 
 
334 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  29.28 
 
 
318 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  30.4 
 
 
362 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  27.89 
 
 
399 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  28.27 
 
 
269 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  43.55 
 
 
290 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  48.98 
 
 
273 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  27.13 
 
 
300 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  29.01 
 
 
249 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  26.48 
 
 
408 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  42.73 
 
 
313 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  52.27 
 
 
314 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  44.14 
 
 
389 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  42.62 
 
 
352 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  31.08 
 
 
391 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  48 
 
 
272 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 
314 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  27.43 
 
 
426 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.79 
 
 
350 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  27.92 
 
 
382 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  40.62 
 
 
289 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  27.49 
 
 
318 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  47 
 
 
272 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  27.46 
 
 
321 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  31.05 
 
 
444 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  27.97 
 
 
382 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  27.97 
 
 
382 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  28.8 
 
 
359 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  31.4 
 
 
384 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  24.15 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  29.04 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  30.3 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  27.65 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  25.42 
 
 
370 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  26.56 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  41.67 
 
 
271 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.4 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  30.89 
 
 
389 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 
351 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  28.11 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  30.89 
 
 
389 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 
389 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  28.23 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  30.92 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  47.19 
 
 
280 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>