More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3139 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
316 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  65.23 
 
 
304 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  64.65 
 
 
308 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  64.88 
 
 
298 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  66.9 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  44.18 
 
 
311 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  44.11 
 
 
299 aa  251  9.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  44.89 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  42.5 
 
 
311 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  38.64 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  34.58 
 
 
328 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  34.06 
 
 
321 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  35.47 
 
 
275 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  33.98 
 
 
360 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  32.36 
 
 
339 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.68 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.56 
 
 
324 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  31.38 
 
 
315 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.81 
 
 
274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.34 
 
 
270 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.83 
 
 
291 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.34 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  30.75 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.19 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  36.58 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  35.8 
 
 
267 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  37.4 
 
 
267 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  32.32 
 
 
344 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.41 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.43 
 
 
316 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  26.37 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  30.9 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  30.6 
 
 
350 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 
350 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 
350 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  29.02 
 
 
358 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  31.53 
 
 
342 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  29.87 
 
 
408 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  29.88 
 
 
399 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  30.14 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  29.77 
 
 
330 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 
337 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  41.8 
 
 
318 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  27.95 
 
 
426 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  28.62 
 
 
269 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.22 
 
 
362 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  28.22 
 
 
337 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
314 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  28.16 
 
 
351 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  29.1 
 
 
337 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  26.52 
 
 
300 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  27.35 
 
 
302 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  26.91 
 
 
544 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  25.95 
 
 
557 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  28.95 
 
 
313 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  27.88 
 
 
405 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  26.25 
 
 
538 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  28.17 
 
 
289 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
525 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
525 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
525 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
517 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
517 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
517 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  28.24 
 
 
525 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.81 
 
 
288 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 
359 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 
532 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 
362 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 
362 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  27.69 
 
 
531 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
532 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
532 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
532 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  27.39 
 
 
525 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  39.29 
 
 
389 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  29.49 
 
 
234 aa  96.3  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
535 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
535 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  26.46 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  29.33 
 
 
279 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  26.36 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  26.73 
 
 
347 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  26.21 
 
 
355 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2748  cytochrome c oxidase subunit II  28.06 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000027283  hitchhiker  0.000000791223 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.04 
 
 
326 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  25.26 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  27.56 
 
 
310 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3150  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit II  28.06 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  28.57 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  25.42 
 
 
249 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>