More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3150 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2748  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000027283  hitchhiker  0.000000791223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3150  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit II  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 
243 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  40.62 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
273 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  28.95 
 
 
276 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  27.91 
 
 
425 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  28.06 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.68 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  26.29 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
321 aa  89  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  26.72 
 
 
272 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  26.64 
 
 
314 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  28.95 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  27.55 
 
 
382 aa  86.3  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.29 
 
 
311 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.28 
 
 
324 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.99 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  24.32 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.69 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.81 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  38.66 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  28.05 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  38.98 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  28.44 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  34.48 
 
 
315 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  27.13 
 
 
377 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.95 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  28.11 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  28.91 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  31.01 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.77 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  38.33 
 
 
321 aa  82  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  33.06 
 
 
313 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  28.15 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  25.37 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  28.44 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  35.34 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  26.75 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  26.1 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  25.11 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  36.28 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  36.29 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  26.61 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  28.43 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  25.63 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  24.1 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  27.55 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  24.1 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  32.77 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
318 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  27.49 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  29.28 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  25.76 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  31.93 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  31.21 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  25.19 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  32.54 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  28.11 
 
 
323 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  35.09 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  25.12 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  27.8 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  23.68 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  35.96 
 
 
360 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  29.72 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  27.35 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  33.08 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  27.23 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  28.44 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.28 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  24.56 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.9 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  22.35 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 
349 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  31.09 
 
 
349 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 
323 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 
349 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  31.09 
 
 
349 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 
349 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 
349 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 
290 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 
349 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  31.09 
 
 
349 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 
349 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 
349 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  34.11 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  26.36 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  25.24 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  26.38 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>