More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01475 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  45.09 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  46.7 
 
 
315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  40.27 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  41.28 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  43.18 
 
 
235 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  38.64 
 
 
261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  35.62 
 
 
327 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 
346 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  39.62 
 
 
378 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  34.19 
 
 
352 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  39.25 
 
 
394 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  36.89 
 
 
334 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  37.7 
 
 
189 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  39.9 
 
 
354 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  39.42 
 
 
434 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  36.15 
 
 
346 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  37.16 
 
 
338 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  35.06 
 
 
338 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  38.76 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.87 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  38.42 
 
 
352 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  36.07 
 
 
334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
352 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  38.16 
 
 
353 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  34.53 
 
 
326 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  34.48 
 
 
334 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  34.47 
 
 
355 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  47.06 
 
 
318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  35.06 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  36.36 
 
 
345 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  35.91 
 
 
425 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  32.87 
 
 
324 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  32.87 
 
 
324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  32.35 
 
 
372 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  32.35 
 
 
381 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  32.74 
 
 
330 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  31.86 
 
 
372 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2772  ubiquinol oxidase, subunit II  32.51 
 
 
296 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0603  ubiquinol oxidase, subunit II  32.51 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  34.33 
 
 
367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2833  ubiquinol oxidase polypeptide II precursor  32.51 
 
 
296 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2714  ubiquinol oxidase, subunit II  31.28 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.218735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34.48 
 
 
370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  34.29 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  31.94 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1788  ubiquinol oxidase, subunit II  31.15 
 
 
377 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0548313  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5793  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  29.18 
 
 
319 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0258171  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 
354 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  28.89 
 
 
300 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5376  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  31.28 
 
 
283 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1722  ubiquinol oxidase, subunit II  32.73 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2880  ubiquinol oxidase, subunit II  32.73 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2410  ubiquinol oxidase, subunit II  32.73 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2090  ubiquinol oxidase, subunit II  32.6 
 
 
281 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  32.31 
 
 
295 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6006  ubiquinol oxidase, subunit II  32.31 
 
 
295 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  43.7 
 
 
322 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.82 
 
 
371 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1209  ubiquinol oxidase, subunit II  30.84 
 
 
295 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0864701  normal  0.353676 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0194  ubiquinol oxidase, subunit II  31.82 
 
 
300 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1369  ubiquinol oxidase, subunit II  31.82 
 
 
300 aa  104  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  38.03 
 
 
316 aa  105  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  30.18 
 
 
299 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2716  ubiquinol oxidase, subunit II  30.45 
 
 
330 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4579  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit II  31.11 
 
 
306 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0993  ubiquinol oxidase, subunit II  30.45 
 
 
300 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0225  ubiquinol oxidase, subunit II  31.82 
 
 
295 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  30.04 
 
 
349 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  32.38 
 
 
353 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1566  ubiquinol oxidase, subunit II  31.82 
 
 
295 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2572  ubiquinol oxidase, subunit II  31.82 
 
 
330 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0479  ubiquinol oxidase, subunit II  30 
 
 
295 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  30.04 
 
 
279 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  30.91 
 
 
301 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  30.52 
 
 
359 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  31.82 
 
 
300 aa  99.4  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3163  ubiquinol oxidase, subunit II  28.82 
 
 
320 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  30.48 
 
 
408 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0954  ubiquinol oxidase, subunit II  28.95 
 
 
302 aa  99  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  30.54 
 
 
302 aa  98.6  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 
304 aa  98.6  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0354  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  29.07 
 
 
315 aa  98.2  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0519619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00383  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  29.07 
 
 
315 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000068734  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00387  hypothetical protein  29.07 
 
 
315 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000137293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0467  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  29.07 
 
 
315 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0849  ubiquinol oxidase, subunit II  30.14 
 
 
313 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3201  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  29.07 
 
 
315 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  hitchhiker  0.0000824271 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0507  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  29.07 
 
 
315 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.47547e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0812  ubiquinol oxidase subunit 2  29.68 
 
 
313 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.642349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0484  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  29.07 
 
 
318 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000643315  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0490  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  29.07 
 
 
318 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000373186  hitchhiker  0.00204632 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0511  cytochrome c oxidase subunit II  30.63 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.263206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0835  ubiquinol oxidase, subunit II  29.68 
 
 
313 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0591  quinol oxidase AA3, subunit II  28.07 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.81 
 
 
314 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0501  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  29.07 
 
 
318 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000104856  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2107  ubiquinol oxidase, subunit II  29.49 
 
 
295 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  31.53 
 
 
350 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>