More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11170 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 
315 aa  621  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  64.01 
 
 
336 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  39.54 
 
 
346 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  41.38 
 
 
327 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  39.75 
 
 
352 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  40.32 
 
 
324 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  40.63 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  40.24 
 
 
334 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  40.55 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  41.94 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  46.7 
 
 
234 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  39.81 
 
 
324 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  43.87 
 
 
314 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  39.87 
 
 
345 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  38.74 
 
 
326 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 
338 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  41.29 
 
 
434 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  35.67 
 
 
334 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  41.75 
 
 
354 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  41.69 
 
 
352 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  39.1 
 
 
346 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  41.37 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  41.16 
 
 
353 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 
355 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  37.34 
 
 
353 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 
330 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  41.15 
 
 
318 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  45.37 
 
 
322 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  40.07 
 
 
370 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  38.01 
 
 
354 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  43.98 
 
 
330 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  37.62 
 
 
381 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  37.95 
 
 
372 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  38.66 
 
 
342 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  37.62 
 
 
372 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  35 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  36.51 
 
 
311 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  30.97 
 
 
359 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  33.52 
 
 
367 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  36.92 
 
 
371 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  41.7 
 
 
244 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  45.93 
 
 
232 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  45.63 
 
 
235 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  30.06 
 
 
349 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  30.06 
 
 
349 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  30.06 
 
 
349 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  30.06 
 
 
349 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  30.06 
 
 
349 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  30.06 
 
 
349 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  30.06 
 
 
349 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  30.06 
 
 
349 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  30.06 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  30.54 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  30.06 
 
 
349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  29.61 
 
 
351 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.23 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  41.23 
 
 
394 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  29.61 
 
 
435 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  30.05 
 
 
425 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  28.9 
 
 
356 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.18 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  36.11 
 
 
261 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  36.67 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.62 
 
 
316 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  30.77 
 
 
279 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  28.94 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  28.94 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  28.94 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  28.94 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4600  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  31.02 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00365456  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  28.94 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  28.94 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0737  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  31.02 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0350513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0758  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  28.94 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0591  quinol oxidase AA3, subunit II  28.45 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  31.78 
 
 
321 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  30.84 
 
 
301 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0511  cytochrome c oxidase subunit II  33.03 
 
 
298 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.263206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 
330 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  30.99 
 
 
243 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 
399 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  27.65 
 
 
377 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  29.03 
 
 
279 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.03 
 
 
279 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  27.01 
 
 
329 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  34.55 
 
 
189 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  32.52 
 
 
279 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  29.85 
 
 
382 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.69 
 
 
314 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  32.73 
 
 
288 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0618  quinol oxidase AA3, subunit II  28.09 
 
 
291 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  31.18 
 
 
279 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  34.2 
 
 
342 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  29.85 
 
 
375 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1637  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  32.14 
 
 
297 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140878  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  30.45 
 
 
285 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  30.45 
 
 
285 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  26.94 
 
 
375 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  29.08 
 
 
300 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  28.07 
 
 
299 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>