More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5502 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
370 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  77.62 
 
 
352 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  77.97 
 
 
352 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  75.35 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  80.89 
 
 
354 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  81.88 
 
 
353 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  67.2 
 
 
381 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  66.78 
 
 
372 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  66.45 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  60.83 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  56.76 
 
 
346 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  57.83 
 
 
338 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  58.41 
 
 
342 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  49.13 
 
 
353 aa  326  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  42.76 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  42.41 
 
 
318 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  41.88 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  53 
 
 
322 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  43 
 
 
327 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  43.58 
 
 
330 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  42.52 
 
 
352 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  42.9 
 
 
336 aa  225  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  42.35 
 
 
334 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  46.25 
 
 
371 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  40.51 
 
 
326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  46.12 
 
 
330 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  39.57 
 
 
354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  39.81 
 
 
334 aa  212  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  41.48 
 
 
338 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  37.65 
 
 
334 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  37.8 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  35.47 
 
 
370 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  41.77 
 
 
314 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  43.03 
 
 
324 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  33.64 
 
 
359 aa  185  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  44.55 
 
 
345 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  33.59 
 
 
425 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  46.67 
 
 
315 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  45.16 
 
 
324 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  45.16 
 
 
324 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  32.35 
 
 
351 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
435 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  33.63 
 
 
349 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
349 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  33.63 
 
 
349 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  33.63 
 
 
349 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  32.59 
 
 
349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  29.9 
 
 
355 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  39.13 
 
 
234 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  30.22 
 
 
356 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.52 
 
 
316 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  30.22 
 
 
356 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  49.57 
 
 
235 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 
362 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  37.06 
 
 
261 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  30.5 
 
 
377 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  37.16 
 
 
232 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  32.39 
 
 
301 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  26.52 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  35.03 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  43.38 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  30.98 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  27.83 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 
378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  30.89 
 
 
310 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  27.37 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  36.22 
 
 
189 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  32.34 
 
 
300 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  29.76 
 
 
384 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  27.37 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  27.04 
 
 
302 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 
380 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  31.16 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  30.65 
 
 
321 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  26.52 
 
 
350 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  29.57 
 
 
359 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 
374 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  28.36 
 
 
279 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  28.81 
 
 
405 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 
329 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  30.42 
 
 
330 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  26.05 
 
 
356 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  27.19 
 
 
342 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
387 aa  106  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0511  cytochrome c oxidase subunit II  32.72 
 
 
298 aa  106  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.263206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  34.69 
 
 
272 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.41 
 
 
401 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  33.56 
 
 
426 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.44 
 
 
279 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  28.44 
 
 
279 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  29.39 
 
 
408 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  37.63 
 
 
378 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.39 
 
 
311 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>