More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0079 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 342 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  79.06 
 
 		 338 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  76.33 
 
 		 346 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  68.04 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  55.05 
 
 		 353 aa  368  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  59.02 
 
 		 434 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  58.72 
 
 		 354 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  55.56 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  58.75 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  58.28 
 
 		 352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  55.13 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  54.81 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  58.1 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  58.28 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  45.08 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  40.88 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  39.81 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  42.49 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  49.36 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  49.78 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  43.96 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  44.88 
 
 		 371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  38.59 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  39.8 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  47.47 
 
 		 334 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  45.41 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  36.92 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  37.57 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  38.05 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  37.35 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  36.57 
 
 		 367 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  39.37 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  37.16 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  37.16 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34.95 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  35.65 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  32.3 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  40.7 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  32.19 
 
 		 425 aa  172  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  39.53 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  37.61 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  29.06 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  29.06 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  29.06 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  27.59 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.23 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  28.75 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  31.64 
 
 		 313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  33.88 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  35.06 
 
 		 234 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  36.94 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  26.25 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  26.13 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  33.99 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  27.65 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  29.94 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.76 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  37.98 
 
 		 261 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  30.96 
 
 		 292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  29.64 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  28.52 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  29.82 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  29.25 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  36.94 
 
 		 232 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  28.62 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  26.76 
 
 		 524 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 374 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  33.87 
 
 		 378 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  44.35 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  30.89 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  25.75 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  26.56 
 
 		 528 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  26.05 
 
 		 532 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  25.56 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  33.18 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.96 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.06 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32.16 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  26.05 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  26.05 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  25.63 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>