More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0771 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  91.6 
 
 
372 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  91.34 
 
 
372 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
381 aa  753    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  69.23 
 
 
352 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  68.27 
 
 
352 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  70.25 
 
 
434 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  70.48 
 
 
354 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  70.83 
 
 
353 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  67.42 
 
 
370 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  56.66 
 
 
346 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  58.23 
 
 
355 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  53.64 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  50.94 
 
 
353 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  53.8 
 
 
338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  41.45 
 
 
346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  42.77 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  41.46 
 
 
318 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  52.07 
 
 
322 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  40.84 
 
 
334 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  43.85 
 
 
338 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  40.89 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  39.55 
 
 
311 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  47.73 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  39.93 
 
 
330 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  43.08 
 
 
371 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  39.12 
 
 
327 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  37.99 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  37.99 
 
 
336 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34.56 
 
 
370 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  38.83 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  35.17 
 
 
367 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  37.88 
 
 
345 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  37.85 
 
 
324 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 
351 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  41.86 
 
 
324 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  42.92 
 
 
315 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  42.33 
 
 
324 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  30.34 
 
 
359 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  33.76 
 
 
349 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
349 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
349 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  32.48 
 
 
349 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.67 
 
 
355 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  37.4 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.64 
 
 
356 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  33.6 
 
 
313 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
314 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  29.61 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 
316 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  38.07 
 
 
235 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  32.8 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.01 
 
 
362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  34.14 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
362 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  37.06 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  31.02 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  32.35 
 
 
234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  26.89 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  30.59 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  29.85 
 
 
350 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  27.55 
 
 
380 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29.78 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  28.66 
 
 
389 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  42.47 
 
 
244 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  29.85 
 
 
350 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  29.85 
 
 
350 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  27.47 
 
 
373 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.84 
 
 
421 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  37.77 
 
 
261 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  27.44 
 
 
389 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  27.44 
 
 
389 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 
374 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  27.34 
 
 
366 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0511  cytochrome c oxidase subunit II  34.07 
 
 
298 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.263206  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  26.94 
 
 
405 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  32.28 
 
 
384 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  32.09 
 
 
301 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 
378 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  30.9 
 
 
329 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  26.01 
 
 
544 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  29.73 
 
 
399 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  28.32 
 
 
382 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.61 
 
 
311 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  25.45 
 
 
538 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  36.04 
 
 
272 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  31.77 
 
 
377 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  31.77 
 
 
377 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  26.3 
 
 
532 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>