More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3098 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  100 
 
 
261 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  97.88 
 
 
189 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  79.31 
 
 
378 aa  363  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  52.31 
 
 
232 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  45.85 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  51.61 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  41.3 
 
 
394 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  38.64 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  41.53 
 
 
336 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  36.22 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  38.5 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  37.39 
 
 
334 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  37.98 
 
 
338 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  35.89 
 
 
346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  33.01 
 
 
346 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  37.1 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
354 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  40.7 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  37 
 
 
434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  37.77 
 
 
372 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  36.06 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  37 
 
 
353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  37.23 
 
 
372 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  36.41 
 
 
353 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  37.23 
 
 
381 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  33.62 
 
 
324 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  37.06 
 
 
370 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  33.92 
 
 
324 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  35.71 
 
 
324 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  35.18 
 
 
352 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  33.66 
 
 
370 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
355 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
334 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
352 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 
338 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.95 
 
 
367 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  36.57 
 
 
315 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  35.07 
 
 
334 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 
326 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  29.87 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  34.86 
 
 
354 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
425 aa  92.8  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  27.98 
 
 
301 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  42.48 
 
 
330 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  33.51 
 
 
345 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  33.33 
 
 
300 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  31.28 
 
 
311 aa  89.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 
371 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  36.05 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  28.97 
 
 
290 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  29.58 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  35.14 
 
 
349 aa  85.1  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  35.14 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  29.79 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  35.14 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  35.14 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0591  quinol oxidase AA3, subunit II  26.15 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  40.95 
 
 
389 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4600  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  26.39 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00365456  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  26.39 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  26.39 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  26.39 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  26.39 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  26.39 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  26.39 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  26.03 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0758  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  26.39 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573305 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0737  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  26.39 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0350513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.04 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  28.45 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  26.42 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  29.11 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  25.75 
 
 
349 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  29.11 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
288 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  29.76 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  39.22 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0618  quinol oxidase AA3, subunit II  24.54 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3649  ubiquinol oxidase, subunit II  28.63 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  34.3 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2882  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  28.69 
 
 
317 aa  79  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6006  ubiquinol oxidase, subunit II  30 
 
 
295 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  30 
 
 
295 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  27.69 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1209  ubiquinol oxidase, subunit II  30.87 
 
 
295 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0864701  normal  0.353676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  32.47 
 
 
337 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0507  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  27.63 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.47547e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0467  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  27.63 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0354  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  27.63 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0519619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>