More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2792 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
330 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  54.18 
 
 
327 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  46.01 
 
 
352 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  45.45 
 
 
324 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  42.17 
 
 
346 aa  249  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  46.77 
 
 
324 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  47.08 
 
 
324 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  42.02 
 
 
326 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  46.29 
 
 
314 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  42.53 
 
 
345 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  40.49 
 
 
334 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  43.64 
 
 
330 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  41.76 
 
 
334 aa  225  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  40.99 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  40.06 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  37.93 
 
 
336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  38.41 
 
 
353 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  42.95 
 
 
352 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  41.91 
 
 
434 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  41.91 
 
 
354 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  39.19 
 
 
381 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  39.19 
 
 
372 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  42.28 
 
 
352 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  38.44 
 
 
354 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  38.85 
 
 
372 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  40.92 
 
 
353 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  45.45 
 
 
370 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  44.39 
 
 
322 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  42.52 
 
 
318 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  35.49 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  38.59 
 
 
355 aa  195  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  36.34 
 
 
342 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  36.74 
 
 
338 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  39.07 
 
 
346 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34.91 
 
 
370 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  35.45 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  34.89 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  36.45 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  34.94 
 
 
425 aa  165  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  29.62 
 
 
349 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30.41 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  29.22 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 
349 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 
349 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 
349 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  29.22 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  29.22 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  29.22 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  37.77 
 
 
359 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  32.57 
 
 
355 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  35.87 
 
 
234 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  33.21 
 
 
330 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  30.8 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  29.1 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  35.02 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  37.1 
 
 
261 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  31.21 
 
 
329 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
300 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  29.02 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  35.6 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  34.77 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  34.77 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.99 
 
 
316 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  32.58 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 
350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  35.94 
 
 
232 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.07 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.85 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  34.08 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.43 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  33.96 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 
350 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 
350 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.6 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 
310 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  31.85 
 
 
362 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  31.05 
 
 
362 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
394 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.92 
 
 
389 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 
318 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  28.86 
 
 
384 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  31.38 
 
 
351 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  34.27 
 
 
235 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  27.64 
 
 
399 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  26.82 
 
 
302 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  35.41 
 
 
378 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  36.92 
 
 
189 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
301 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  34.21 
 
 
356 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 
359 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  27.64 
 
 
408 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
374 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  33.8 
 
 
366 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  31 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 
384 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  37.09 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>