More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3825 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 189 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  97.88 
 
 		 261 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  82.45 
 
 		 378 aa  303  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  54.01 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  47.78 
 
 		 244 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  50.53 
 
 		 235 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  44.56 
 
 		 394 aa  131  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  41.54 
 
 		 336 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  37.7 
 
 		 234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  39.34 
 
 		 327 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  36.13 
 
 		 352 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  36.73 
 
 		 338 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  41.44 
 
 		 314 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  34.69 
 
 		 346 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  37.64 
 
 		 372 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 354 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  37.08 
 
 		 381 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  37.08 
 
 		 372 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  35.83 
 
 		 434 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34 
 
 		 370 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  36.68 
 
 		 334 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  36.92 
 
 		 330 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  31.12 
 
 		 346 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  36.72 
 
 		 324 aa  101  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  36.72 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  35.35 
 
 		 342 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  36.46 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  36.08 
 
 		 370 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  34.55 
 
 		 355 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  34 
 
 		 367 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  35.83 
 
 		 353 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  34.22 
 
 		 352 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 		 353 aa  97.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  35.82 
 
 		 338 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  33.69 
 
 		 352 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  42.48 
 
 		 330 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  34.83 
 
 		 334 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  29.33 
 
 		 314 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  35.11 
 
 		 334 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  34.44 
 
 		 315 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  36.05 
 
 		 318 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  38.24 
 
 		 371 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  28.97 
 
 		 290 aa  87  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  33.73 
 
 		 345 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  33.5 
 
 		 354 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  34.82 
 
 		 349 aa  84.3  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  34.82 
 
 		 349 aa  84.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 		 349 aa  84.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 		 349 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 		 320 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  34.82 
 
 		 349 aa  84.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 		 349 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 		 320 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 		 349 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 		 349 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  40.87 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  36.17 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  28.34 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  30.09 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  27.5 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  31.07 
 
 		 288 aa  81.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.04 
 
 		 302 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 349 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  35.96 
 
 		 316 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  39.22 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  32.42 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  36.48 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  31.44 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  31.29 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3536  ubiquinol oxidase, subunit II  38.39 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  32.89 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 		 336 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  33.51 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  33.58 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  33.51 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  41.76 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  32.62 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  27.12 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  34.92 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  43.68 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  43.68 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  41.75 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  43.68 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4600  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  32.46 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0758  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  32.46 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  32.46 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  32.46 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  32.46 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  32.46 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3649  ubiquinol oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  27.75 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  32.46 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  32.46 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  32.16 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0737  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  32.46 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0350513  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3060  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  37.37 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000967712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>