More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0414 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  100 
 
 
311 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  44.19 
 
 
316 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  41.23 
 
 
302 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  37.96 
 
 
351 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  43.19 
 
 
330 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  38.44 
 
 
329 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  38.08 
 
 
408 aa  245  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  36.42 
 
 
350 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  36.42 
 
 
350 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 
350 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  37.1 
 
 
342 aa  239  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  42.86 
 
 
288 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  34.69 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  37.04 
 
 
426 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
399 aa  228  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  35.16 
 
 
314 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  36.24 
 
 
405 aa  222  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  33.53 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  33.63 
 
 
382 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  33.63 
 
 
382 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
362 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  33.53 
 
 
382 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  39.19 
 
 
362 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  36.54 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  36.33 
 
 
313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  33.24 
 
 
382 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  37.84 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  34.52 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  34.52 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  35.16 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  32.46 
 
 
384 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  33.56 
 
 
318 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  35.5 
 
 
310 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.47 
 
 
316 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  35.88 
 
 
301 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  32.74 
 
 
384 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  33.24 
 
 
394 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  34.21 
 
 
329 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  33.79 
 
 
318 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.89 
 
 
359 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  30.77 
 
 
391 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  31.82 
 
 
444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  31.18 
 
 
388 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  29.9 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.27 
 
 
211 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  31.83 
 
 
355 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  28.27 
 
 
344 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  31.75 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  28.01 
 
 
311 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  28.41 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.3 
 
 
304 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.37 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  29.71 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  31.46 
 
 
302 aa  132  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  27.89 
 
 
320 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  27.89 
 
 
320 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  30.08 
 
 
298 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  32.74 
 
 
275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  32.26 
 
 
276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.96 
 
 
291 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  25.85 
 
 
370 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  35.61 
 
 
267 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.63 
 
 
267 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  27.56 
 
 
321 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.15 
 
 
267 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  25.54 
 
 
367 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  28.25 
 
 
269 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.57 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  26.52 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.57 
 
 
270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  33.8 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  27.07 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0515  cytochrome c class I  53.68 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  26.67 
 
 
349 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  26.35 
 
 
349 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  26.35 
 
 
349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  26.35 
 
 
349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.47 
 
 
274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  25.5 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  26.35 
 
 
349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  26.35 
 
 
349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  26.35 
 
 
349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  26.35 
 
 
349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  31.15 
 
 
311 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  25.94 
 
 
557 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  30.84 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  33.48 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  34.65 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  25.55 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  26.98 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  32.16 
 
 
314 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  25.36 
 
 
373 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  26.62 
 
 
359 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 
544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  27.69 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  30.77 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  30.59 
 
 
372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>