87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0515 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0515  cytochrome c class I  100 
 
 		 176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  49.54 
 
 		 388 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  53.68 
 
 		 311 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  52.38 
 
 		 330 aa  108  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  55.17 
 
 		 342 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  50 
 
 		 382 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 		 382 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  46.23 
 
 		 382 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 330 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  49.44 
 
 		 394 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  46.23 
 
 		 382 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  43.1 
 
 		 384 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 350 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 350 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  42.71 
 
 		 389 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  40.86 
 
 		 399 aa  99.4  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  48.91 
 
 		 329 aa  99  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  45.56 
 
 		 384 aa  99  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  44.09 
 
 		 444 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  43.56 
 
 		 350 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  45.05 
 
 		 313 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  39.8 
 
 		 351 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  44.55 
 
 		 310 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 		 358 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  46.07 
 
 		 362 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  43.18 
 
 		 316 aa  91.3  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  47.87 
 
 		 318 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  40.52 
 
 		 316 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  41.49 
 
 		 391 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  42.55 
 
 		 426 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  47.19 
 
 		 362 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  46.07 
 
 		 362 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  45.56 
 
 		 314 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  42.55 
 
 		 359 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  41.94 
 
 		 920 aa  84.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  36.8 
 
 		 300 aa  84.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  39.78 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  38.54 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  40.43 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 405 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  41.76 
 
 		 301 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  37.63 
 
 		 329 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  31.11 
 
 		 318 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  33.03 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 		 337 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  32.65 
 
 		 337 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  33.85 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  28.74 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  34.26 
 
 		 290 aa  48.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  34.26 
 
 		 290 aa  47.8  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 101 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  31.88 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  22.28 
 
 		 537 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  30.97 
 
 		 477 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  28.17 
 
 		 277 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0161  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.822245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  28 
 
 		 1181 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 691 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0593  hypothetical protein  29.46 
 
 		 292 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  26.96 
 
 		 537 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.85 
 
 		 434 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  54.29 
 
 		 432 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  54.29 
 
 		 432 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  54.29 
 
 		 432 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  54.29 
 
 		 432 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  54.29 
 
 		 432 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  54.29 
 
 		 432 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 437 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  54.29 
 
 		 432 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  54.29 
 
 		 432 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  58.62 
 
 		 432 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  30.7 
 
 		 421 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.29 
 
 		 477 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  58.62 
 
 		 432 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  58.62 
 
 		 432 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  51.43 
 
 		 432 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  34.26 
 
 		 712 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  32.41 
 
 		 470 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  30.41 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2272  cytochrome c, class I  30.08 
 
 		 458 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  28.72 
 
 		 100 aa  40.8  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.86 
 
 		 447 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.9 
 
 		 432 aa  40.8  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0097  cytochrome c class I  40.43 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.340864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>