69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3436 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  100 
 
 
290 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  99.66 
 
 
290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  55.86 
 
 
277 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  55.86 
 
 
272 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  33.18 
 
 
253 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  39.42 
 
 
238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  37.96 
 
 
238 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  38.46 
 
 
149 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  36.97 
 
 
144 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  40.16 
 
 
150 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  41.94 
 
 
148 aa  96.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  38.21 
 
 
146 aa  96.3  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  41.03 
 
 
148 aa  96.3  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  38.21 
 
 
146 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  40.62 
 
 
150 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  38.21 
 
 
146 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  38.28 
 
 
150 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  37.84 
 
 
141 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  39.84 
 
 
150 aa  92.8  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  37.8 
 
 
150 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  35.94 
 
 
173 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  36.44 
 
 
141 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  37.21 
 
 
150 aa  89.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  36.57 
 
 
150 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  35.45 
 
 
142 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  36.29 
 
 
150 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  36.64 
 
 
150 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  38.76 
 
 
147 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  37.69 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  28.37 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  37.69 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  36.59 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  38.78 
 
 
200 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  30.57 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  32.32 
 
 
862 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.73 
 
 
487 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  35.66 
 
 
155 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 
535 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 
535 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1709  cytochrome c class I  32.43 
 
 
129 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 
535 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 
330 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 
535 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.58 
 
 
863 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 
535 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  34.38 
 
 
690 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 
487 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 
487 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  29.55 
 
 
864 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  36.54 
 
 
359 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0515  cytochrome c class I  34.26 
 
 
176 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  37.63 
 
 
310 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  34.04 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  34.95 
 
 
362 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  34.04 
 
 
382 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  34.04 
 
 
382 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  37.27 
 
 
127 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  71.43 
 
 
224 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  29.67 
 
 
384 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  28.05 
 
 
117 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  26.32 
 
 
408 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  28.57 
 
 
227 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 
367 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 
344 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 
316 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  29.9 
 
 
262 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3501  cytochrome c, class I  52.17 
 
 
225 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>